您好，关于您在公司系统上提交离职申请后何时能拿到离职协议书（通常称为离职证明）的问题，我可以为您详细解答。

首先，根据《中华人民共和国劳动合同法》第五十条的规定，用人单位应当在解除或者终止劳动合同时，即您正式离职的当天或之前，出具解除或者终止劳动合同的证明，也就是我们常说的离职证明。这是用人单位的法定义务，必须及时履行，不得以任何理由拖延或拒绝。

离职证明对于您来说非常重要，它不仅是您与原用人单位劳动关系终结的书面凭证，还是您进行失业登记、享受失业待遇以及再次求职时的必备文件。因此，您有权要求用人单位在离职时及时出具离职证明。

关于离职证明的内容，根据《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第二十四条的规定，离职证明应当写明劳动合同期限、解除或者终止劳动合同的日期、工作岗位以及在本单位的工作年限。这些信息都是客观描述您在原用人单位的基本工作情况，无需包含任何主观评价或劳资双方权利义务的结算内容。

如果用人单位在您离职时未能及时出具离职证明，或者出具的离职证明内容不符合法律规定，您有权向劳动监察部门进行投诉或直接提起劳动仲裁，要求用人单位重新开具符合法律要求的离职证明，并可能因此获得相应的赔偿。

综上所述，您在公司系统上提交离职申请后，用人单位应当在您正式离职的当天或之前出具离职证明。如果用人单位未能及时出具，您可以采取相应的法律措施来维护自己的权益。希望这个解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。