结论：签字的赔偿协议是否还有效，取决于多种因素，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、协议内容合法且双方自愿签署
- 协议内容合法：如果赔偿协议的内容符合法律法规的规定，没有违反法律强制性规定或公序良俗，且双方是在平等、自愿的基础上签署的，那么该协议通常是有效的。
- 双方自愿签署：在签署协议时，双方应当充分理解协议的内容，并自愿接受协议的约束。如果公司在签署协议时没有采取欺诈、胁迫等手段，且员工也确实是在自愿的情况下签署的，那么协议的有效性通常不会受到质疑。
在此情况下，即使员工事后发现赔偿方案不合理，也难以主张协议无效或撤销。因为协议已经满足了法律规定的生效要件，双方都应当按照协议的约定履行各自的义务。
二、协议存在法定无效或可撤销情形
法定无效情形：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，如果赔偿协议存在以下情形之一的，该协议无效：
- 无民事行为能力人实施的民事法律行为；
- 行为人与相对人以虚假的意思表示实施的民事法律行为；
- 违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为（但是，该强制性规定不导致该民事法律行为无效的除外）；
- 违背公序良俗的民事法律行为；
- 行为人与相对人恶意串通，损害他人合法权益的民事法律行为。
可撤销情形：如果公司在签署协议时存在欺诈、胁迫等手段，或者员工在签署协议时存在重大误解，那么员工可以在法定期限内（一般为知道或应当知道撤销事由之日起一年内）向法院或仲裁机构申请撤销该协议。
在此情况下，如果员工能够证明协议存在法定无效或可撤销的情形，那么该协议可能被认定为无效或被撤销。员工可以据此要求公司重新协商赔偿方案或寻求其他法律救济。
三、建议与行动
- 审查协议内容：首先，员工应当仔细审查赔偿协议的内容，确认是否存在上述法定无效或可撤销的情形。
- 收集证据：如果员工认为协议存在不合法或不合理之处，应当尽快收集相关证据，如公司欺诈、胁迫的证据，或者员工在签署协议时存在重大误解的证据等。
- 咨询专业律师：在收集到足够证据后，员工可以咨询专业律师（如我，景芋衡律师，专注于劳动纠纷领域），了解具体的法律救济途径和策略。
- 采取法律行动：根据律师的建议，员工可以选择向法院或仲裁机构提起诉讼或申请仲裁，要求确认协议无效或撤销协议，并寻求合理的赔偿方案。
最后，需要强调的是，劳动纠纷的处理往往涉及复杂的法律问题和程序。因此，在处理此类纠纷时，建议员工保持冷静、理性，并尽快寻求专业律师的帮助。如果你有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。