结论：残疾职工将残疾证交给公司后，能否与公司协商政府给的补贴，需视具体情况而定，包括补贴的性质、发放对象以及双方协商的内容等。以下从不同角度进行分析：

1. 补贴性质与发放对象：

   • 若补贴是针对残疾职工个人的：如残疾津贴、生活补助等，这类补贴通常直接发放给残疾职工本人，用于保障其基本生活或补偿其因残疾而产生的额外支出。在此情况下，残疾职工有权自主支配这些补贴，公司无权干涉，更无权要求残疾职工将补贴交予公司或与公司进行协商分配。
   • 若补贴是针对公司的：如企业因雇佣残疾职工而获得的税收减免、岗位补贴等，这类补贴的发放对象是公司，旨在鼓励企业雇佣残疾职工，促进残疾人就业。在此情况下，残疾职工无权直接要求公司分配这些补贴，但可以与公司就补贴的使用情况进行沟通，确保补贴用于改善残疾职工的工作条件或提高其福利待遇。

2. 双方协商的内容与合法性：

   • 协商内容合法：如果残疾职工与公司协商的是关于如何更好地利用政府补贴来改善残疾职工的工作环境、提高福利待遇或促进残疾人就业等合法、合理的内容，那么这种协商是值得鼓励的。双方可以在平等、自愿的基础上达成协议，并明确各自的权利和义务。
   • 协商内容违法：如果协商的内容涉及将政府补贴非法转移、侵占或用于其他非法目的，如要求残疾职工将补贴交予公司作为“管理费”或“手续费”等，那么这种协商是违法的，不仅损害了残疾职工的合法权益，也违反了国家关于残疾人保障和补贴发放的相关规定。

3. 法律建议：

   • 残疾职工方面：在将残疾证交给公司前，应了解清楚政府补贴的性质、发放对象和用途，确保自己的合法权益不受侵害。如果公司提出与补贴相关的协商要求，应谨慎对待，必要时可咨询专业律师或相关部门，确保协商内容的合法性和合理性。
   • 公司方面：应严格遵守国家关于残疾人保障和补贴发放的相关规定，不得非法侵占或挪用政府补贴。如果希望与残疾职工就补贴的使用情况进行沟通，应确保沟通内容的合法性和合理性，并尊重残疾职工的意愿和选择。

可能法律后果：

• 如果公司非法侵占或挪用政府补贴，可能面临行政处罚或刑事责任，同时需要承担对残疾职工的赔偿责任。
• 如果残疾职工与公司就补贴问题产生纠纷，可以通过法律途径解决，如向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼等。

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