针对您提出的“要求离职再去总公司办理入职是否合法”的问题，这主要涉及到的是用工风险控制和法律合规性方面。
首先，我们要明确的是，根据《劳动合同法》第九十一条的规定，用人单位在招用新员工时，有义务确保该员工不与其他用人单位存在尚未解除或终止的劳动合同关系。如果因为招用了这样的员工而给其他用人单位造成了损失，那么新用人单位是需要承担连带赔偿责任的。
基于这一法律规定，用人单位在要求新员工入职时提供离职证明或失业证明，是一种合理的用工风险控制方式。这样的要求可以帮助用人单位核实新员工是否已经与原单位解除了劳动关系，是否存在竞业禁止等可能影响新工作的情形。
现在，回到您的问题本身，“要求离职再去总公司办理入职”这一做法，从法律合规性的角度来看，并不直接构成违法。但关键在于，这一要求是否合理且必要。如果总公司要求您先离职再办理入职，是为了确保您与原单位已经解除了劳动关系，从而避免可能的法律风险，那么这种要求是可以理解的。
然而，您也需要注意以下几点：
离职与入职的时间安排：确保在离职和入职之间有足够的时间处理相关手续，避免因为时间紧迫而出现疏漏或问题。
离职证明的获取：在离职时，务必要求原单位出具正式的离职证明，并妥善保管，以便在入职新单位时提供。
与新单位的沟通：在离职前，最好与新单位（即总公司）就入职的具体要求、时间安排等进行充分沟通，确保双方对入职流程有清晰的认识和共识。
综上所述，要求离职再去总公司办理入职这一做法，在法律上并不直接构成违法，但关键在于这一要求的合理性和必要性，以及您在处理离职和入职手续时的谨慎和周全。如果您对这一要求有任何疑问或担忧，建议与新单位进行进一步沟通，以明确双方的权利和义务。