当出租车被追尾且对方被认定为全责时，关于修车期间的停运损失应由谁来承担，这是一个涉及法律条款和保险责任的问题。以下是我为您提供的详细解答：

一、停运损失的性质与赔偿主体

出租车作为营运车辆，其因交通事故导致的停运损失属于间接财产损失。根据《最高人民法院关于审理道路交通事故损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》，依法从事经营性活动的车辆因事故无法运营所产生的合理停运损失，应由侵权人（即全责方）进行赔偿。

二、保险公司的赔偿责任

1. 交强险：

   • 交强险主要赔付的是人身伤亡和直接财产损失。在大多数情况下，停运损失被视为间接损失，因此不在交强险的常规赔付范围内。
   • 但在某些特定的司法实践中，如果法院认为停运损失是合理且必要的，可能会判决交强险在财产损失赔偿限额内对合理的停运损失予以有限赔偿。不过，这种情况相对较少，且具体赔偿金额会受到交强险赔偿限额的限制。

2. 商业三者险：

   • 商业三者险的赔偿责任则取决于保险合同的具体条款。多数商业三者险合同会将间接损失（如停运损失）列为免责范围。
   • 然而，如果保险公司未就免责条款向投保人尽到提示和明确说明义务，那么该免责条款可能不产生法律效力。在这种情况下，保险公司就需要承担停运损失的赔偿责任。

三、责任方的承担

• 如果保险公司不承担或仅部分承担停运损失，那么剩余部分应由负全责的侵权人（即对方车主或驾驶员）承担。
• 为了证明停运损失的具体金额，出租车一方需要提供充分的证据，如运营收入流水、维修时间证明等。这些证据将有助于确定停运时间和损失金额，从而为赔偿提供依据。

四、维权途径

1. 协商：首先，您可以尝试与对方或其保险公司进行协商，明确停运损失的计算方法和金额，并争取达成赔偿协议。
2. 调解：如果协商无果，您可以请求交警部门进行调解。交警部门具有权威性和公信力，他们的调解往往能够促进双方的有效沟通并达成赔偿协议。
3. 诉讼：如果上述方式均无法解决问题，您可以向法院提起诉讼。通过法律程序，您可以维护自身的合法权益并获得应有的赔偿。

综上所述，当出租车被追尾且对方全责时，停运损失的承担主体和责任划分需根据具体情况而定。但无论如何，出租车一方都有权要求全责方进行赔偿，并通过合法途径（如协商、调解或诉讼）来维护自身的权益。