结论：因迟到被扣绩效并被辞退是否有补偿，需根据具体情况判断，主要包括迟到行为的严重性、公司规章制度是否合法以及辞退程序是否合规等因素。以下从不同角度详细分析：

一、迟到行为与辞退的合法性

1. 迟到行为的性质：

   • 迟到通常被视为违反公司规章制度的行为，但并非所有迟到行为都足以构成辞退的合法理由。
   • 如果迟到行为轻微且偶尔发生，公司通常应通过警告、罚款等方式进行管理，而非直接辞退。

2. 公司规章制度的合法性：

   • 公司规章制度必须合法、合理，且经过民主程序制定并公示，才能作为辞退员工的依据。
   • 如果公司规章制度中未明确规定迟到多少次或达到何种程度可以辞退，或者规定过于严苛、不合理，那么以此为由辞退员工可能构成违法辞退。

二、辞退程序与补偿

1. 合法辞退的情况：

   • 如果员工迟到行为严重违反公司规章制度，且公司规章制度合法有效，同时辞退程序合规（如提前通知、听取员工意见等），那么公司辞退员工可能无需支付经济补偿。
   • 但即便如此，如果公司扣除了员工的绩效工资，且该扣除行为缺乏合法依据或未按照公司规章制度执行，员工仍有权要求公司返还被扣除的绩效工资。

2. 违法辞退的情况：

   • 如果公司辞退员工的行为被认定为违法（如规章制度不合法、辞退程序不合规等），那么员工有权要求公司支付经济补偿。
   • 经济补偿的计算通常根据员工在公司的工作年限、月工资等因素确定。具体计算公式为：经济补偿 = 工作年限 × 月工资（月工资是指员工在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资）。
   • 如果公司未提前三十日以书面形式通知员工辞退，还需额外支付一个月工资作为代通知金。

三、建议与行动

1. 收集证据：

   • 员工应收集与迟到、公司规章制度、辞退程序相关的证据，如考勤记录、公司规章制度文本、辞退通知等。

2. 与公司协商：

   • 在掌握一定证据后，员工可以尝试与公司协商，要求公司返还被扣除的绩效工资或支付经济补偿。

3. 申请劳动仲裁：

   • 如果协商无果，员工可以向当地劳动仲裁机构申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。

4. 咨询专业律师：

   • 在整个过程中，员工如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议和指导。

总结：因迟到被扣绩效并被辞退是否有补偿，需根据具体情况判断。员工应了解自己的权益和公司的规章制度，收集相关证据，并在必要时寻求法律帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。