若营运客车发生事故且驾驶员负主责，核心处理方向如下，需结合事故具体情况分步骤应对：

一、责任认定后的法律义务

1. 立即履行报告义务
   根据《道路交通安全法》第70条，驾驶员需在事故发生后立即停车、保护现场，并迅速报告交警部门。若造成人员伤亡，还需同时报告急救部门。若未履行报告义务，可能面临200-2000元罚款及15日以下拘留（《道路交通安全法》第99条）。

2. 配合调查与证据固定
   交警部门会出具《事故责任认定书》，明确主责比例（通常为70%以上）。驾驶员需配合提供行车记录仪、监控录像、证人证言等证据，避免因证据缺失导致责任扩大。

二、赔偿责任的承担主体

1. 驾驶员个人责任
   若事故因驾驶员故意违章（如酒驾、毒驾、超速50%以上）导致，保险公司可能拒赔，驾驶员需自行承担全部赔偿（《机动车交通事故责任强制保险条例》第22条）。

2. 单位连带责任
   根据《民法典》第1191条，若驾驶员属职务行为（如执行公司运输任务），单位需与驾驶员承担连带赔偿责任。单位赔偿后，可向存在重大过失的驾驶员追偿。

3. 保险公司赔付范围
   交强险优先赔付（医疗费最高1.8万、死亡伤残最高18万），商业三者险按责任比例赔付。但若车辆未年检、驾驶员无从业资格证等，保险公司可能拒赔（《机动车商业保险示范条款》第24条）。

三、具体应对步骤

1. 现场处理

   • 立即设置警示标志，避免二次事故；
     
   • 拍摄现场照片、视频，记录对方车辆信息、保险单号；
     
   • 保留医疗费发票、误工证明等损失证据。

2. 协商与诉讼

   • 协商阶段：与对方或其保险公司协商赔偿金额，需注意保留书面协议；
     
   • 诉讼阶段：若协商不成，需在3年诉讼时效内起诉（《民法典》第188条），重点举证对方损失与事故的因果关系。

3. 单位内部处理

   • 若属职务行为，及时向单位报告并提交事故材料；
     
   • 单位可能根据内部规章制度对驾驶员进行处罚（如扣发奖金、停职培训），但处罚需合理且符合劳动合同约定。

四、风险防范建议

1. 驾驶员层面

   • 定期参加安全培训，避免疲劳驾驶、分心驾驶；
     
   • 保留车辆维护记录，证明车辆符合安全标准。

2. 单位层面

   • 为营运车辆投保足额商业险（建议三者险不低于200万）；
     
   • 建立事故应急预案，明确责任划分与赔偿流程。

若您是驾驶员或单位负责人，需进一步分析事故细节（如伤亡情况、保险条款等），可直接向我提供具体信息，我将为您定制应对方案。