将公司货款用于抵扣工资的行为通常是不合法的。以下从不同角度为你详细分析：
法律角度
货款性质与工资支付义务：
- 公司货款是公司与客户之间因交易而产生的应收款项，属于公司的财产。
- 工资是员工为公司提供劳动后应得的报酬，公司有义务按时足额支付。
- 将货款用于抵扣工资，实际上是将公司的财产用于履行公司的债务（支付工资），但这并不改变货款和工资的法律性质，也不符合工资支付的法定程序。
违法行为及后果：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，公司应当以货币形式按月支付给劳动者本人工资，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
- 如果公司未经员工同意，擅自将货款用于抵扣工资，可能构成克扣工资的行为，员工有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，要求公司支付被克扣的工资及可能的赔偿金。
合法抵扣的情形：
- 当然，也存在一些特殊情况，如员工与公司之间存在明确的书面协议，约定在特定条件下可以用货款抵扣工资。但这种情况需要满足严格的法律条件，如协议必须合法有效、员工必须明确同意等。
实际操作角度
货款管理：
- 公司应建立完善的货款管理制度，确保货款及时收回并用于公司的正常运营。
- 将货款用于抵扣工资会打乱公司的资金流，影响公司的正常运营和财务状况。
工资支付流程：
- 公司应建立规范的工资支付流程，确保工资按时足额支付给员工。
- 如果公司确实面临资金困难，应与员工协商解决方案，如延期支付、分期支付等，而不是擅自将货款用于抵扣工资。
建议与措施
对于公司：
- 应严格遵守劳动法律法规，按时足额支付员工工资。
- 如果确实面临资金困难，应积极与员工沟通，寻求合理的解决方案。
- 加强货款管理，确保货款及时收回并用于公司的正常运营。
对于员工：
- 如果发现公司擅自将货款用于抵扣工资，应及时向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。
- 在与公司协商时，应保留好相关证据，如工资条、银行转账记录等，以便在需要时维护自己的合法权益。
综上所述，将公司货款用于抵扣工资的行为通常是不合法的。公司应严格遵守劳动法律法规，按时足额支付员工工资；员工也应积极维护自己的合法权益，及时投诉或提起劳动仲裁。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。