结论：在交通事故中，即使存在第三方赔偿，受害者仍然可以走工伤赔偿程序。两者并不冲突，且在一定条件下可兼得或相互补充。
一、法律依据与工伤认定
工伤认定条件：
- 根据《工伤保险条例》第十四条，职工在上下班途中，受到非本人主要责任的交通事故伤害，应认定为工伤。这意味着，只要事故责任不在职工本人，且发生在上下班途中，即可申请工伤认定。
第三方赔偿与工伤赔偿的关系：
- 根据《中华人民共和国社会保险法》第四十二条，因第三人原因造成工伤且第三人不支付或无法确定第三人的，由工伤保险基金先行支付，并有权向第三人追偿。这表明，工伤赔偿与第三方赔偿是独立的，受害者有权同时主张两者。
二、工伤赔偿与第三方赔偿的具体操作
工伤赔偿流程：
- 申请工伤认定：向用人单位所在地的社会保险行政部门提出工伤认定申请，提交相关材料，如劳动合同、医疗诊断证明、事故责任证明等。
- 劳动能力鉴定：如因工伤导致残疾，需进行劳动能力鉴定以确定伤残等级。
- 申请工伤保险待遇：根据工伤认定和劳动能力鉴定结果，向工伤保险经办机构申请待遇，包括一次性伤残补助金、医疗费用等。
第三方赔偿流程：
- 确定责任：及时报警，由交警部门出具交通事故责任认定书。
- 协商赔偿：与对方及保险公司协商，包括伤残赔偿、医疗费用等。
- 诉讼解决：若协商不成，向法院提起民事诉讼，提供相关证据支持索赔请求。
三、赔偿项目的区分与避免重复获赔
可双重赔偿的项目：
- 伤残赔偿金/工亡补助金、误工费/停工留薪期工资等，因两者性质和目的不同，可同时获得。
不可双重赔偿的项目：
- 医疗费，具有确定性和唯一性，只能由一方承担。在实际操作中，若受害者已从工伤保险中获得部分医疗费用赔偿，在向第三方索赔时应相应扣减已获赔部分，以避免重复获赔。
四、第三方不赔付时的处理
调解或诉讼：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第七十四条，受害者可选择请求公安机关交通管理部门调解或直接向人民法院提起民事诉讼来维权。
工伤保险基金先行支付：
- 当第三方不支付或无法确定时，工伤保险基金将先行支付相关费用，并保留向第三方追偿的权利。
五、实际操作注意事项
- 保留证据：受害者应妥善保存所有与工伤和交通事故相关的证据，如医疗记录、事故责任认定书、劳动合同等，以便后续使用。
- 及时申请：务必在规定时间内申请工伤认定和赔偿，以及向第三方主张赔偿，以免错过时效。
- 咨询专业意见：在处理此类复杂案件时，建议受害者咨询专业律师，如我本人万亚明，以确保自身权益得到充分保护。
综上所述，交通事故中即使存在第三方赔偿，受害者仍然可以走工伤赔偿程序。两者并行不悖，但需注意避免医疗费用的重复获赔。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。