国企农民合同制工人辞退是否有补偿，主要取决于辞退的具体原因及是否符合相关法律法规的规定。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、合法辞退情形下的经济补偿
协商一致解除劳动合同：
- 如果国企与农民合同制工人协商一致解除劳动合同，根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条，国企需按照劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付经济补偿。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。
- 计算公式：经济补偿 = 工作年限 × 月工资（月工资为劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资）
无过失性辞退：
- 若农民合同制工人因患病或非因工负伤，医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由国企另行安排的工作；或不能胜任工作，经过培训或调整工作岗位后仍不能胜任；或劳动合同订立时所依据的客观情况发生重大变化，致使劳动合同无法履行，且双方未能就变更劳动合同内容达成协议，国企可提前三十日书面通知或额外支付一个月工资后解除劳动合同，并支付经济补偿。
- 补偿标准：同上，即按工作年限和月工资水平支付经济补偿。
经济性裁员：
- 国企在特定情形下（如破产重整、生产经营严重困难等）进行大规模裁员，需履行法定程序后支付经济补偿。
- 程序要求：提前三十日向工会或全体职工说明情况，听取意见后，裁减人员方案经向劳动行政部门报告。
- 补偿标准：同样按照工作年限和月工资水平支付经济补偿。
二、违法辞退情形下的赔偿金
- 若国企辞退农民合同制工人不符合法定情形，构成违法解除劳动合同，根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，国企应按照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。
- 计算公式：赔偿金 = 2 × 经济补偿 = 2 × 工作年限 × 月工资
三、无需支付补偿的情形
- 员工自身原因：如试用期间不符合录用条件、严重违反规章制度、严重失职营私舞弊给公司造成重大损害等，国企可辞退且无需补偿。
- 员工主动离职：若农民合同制工人主动提出解除劳动合同，国企亦无需支付经济补偿。
四、特殊群体的保护与补偿
- 对于孕期、产期、哺乳期女职工，以及工伤或职业病员工等特殊群体，即使被合法辞退，国企也需特别注意其权益保护，可能涉及额外的补偿和福利。例如，孕期、产期、哺乳期女职工在劳动合同期满时，劳动合同应当续延至相应的情形消失时终止，国企不得因此辞退员工而不支付补偿。
五、实际操作中的注意事项
- 提前通知与工会参与：辞退员工需提前30日书面通知或支付代通知金，并通知工会，确保程序的合法性。
- 税务处理：补偿金在当地职工平均工资3倍以内的部分免税，超出部分需按个人所得税规定缴纳，国企在支付补偿金时需注意税务处理。
- 争议解决：若对补偿金额有异议，双方应首先协商解决；协商不成时，可向劳动仲裁机构申请仲裁或提起诉讼，通过法律途径维护自身权益。
总结来说，国企农民合同制工人辞退是否有补偿，需根据辞退的具体原因、员工的工作年限、月工资水平及是否属于特殊群体等多重因素综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。