针对您提出的“十三岁时怀孕十六岁时还能起诉吗”这一问题，我们需要从法律的角度进行详细分析。

首先，我们要明确的是，起诉的权益并不直接受年龄增长的影响，但关键在于起诉的内容和法律依据。在您所描述的情况中，涉及的是未成年人之间的性行为以及可能的法律责任问题。

1. 关于刑事责任：

   • 根据我国《中华人民共和国刑法》的相关规定，已满十六周岁的人犯罪，应当负刑事责任。对于已满十四周岁不满十六周岁的人，只有犯故意杀人、故意伤害致人重伤或者死亡、强奸、抢劫、贩卖毒品、放火、爆炸、投放危险物质罪的，才应当负刑事责任。
   • 在您所描述的情况中，如果十三岁时发生的性行为涉及到了强奸等犯罪行为，且当时加害方已满十四周岁，那么理论上在加害方十六岁时，受害方或其法定代理人是有权向公安机关报案，并由检察机关提起公诉的。但这里的关键是要有充分的证据证明当时发生了犯罪行为。

2. 关于民事责任：

   • 无论加害方是否承担刑事责任，如果其行为给受害方造成了物质损失或精神损害，受害方都有权要求赔偿。
   • 根据我国《民法典》的相关规定，行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。这包括医疗费、护理费、交通费、营养费、住院伙食补助费等为治疗和康复支出的合理费用，以及因误工减少的收入。造成残疾或死亡的，还应赔偿相应的残疾赔偿金或死亡赔偿金。

3. 关于起诉的时效：

   • 一般来说，民事诉讼的时效期间为三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。但特殊情况下，如涉及未成年人遭受性侵害的损害赔偿请求权，诉讼时效期间可能自受害人年满十八周岁之日起计算。
   • 在刑事诉讼方面，对于犯罪行为的追诉时效则根据犯罪的性质和情节严重程度而定，但通常不会因为受害方的年龄增长而失效。

4. 实际操作建议：

   • 如果您或您认识的人遇到了类似情况，建议首先向公安机关报案，由公安机关进行调查取证。
   • 同时，可以咨询专业律师，了解具体的法律程序和可能的赔偿范围。
   • 在整个过程中，要保护好受害方的隐私和权益，避免对其造成二次伤害。

综上所述，十三岁时怀孕，十六岁时仍然有可能根据具体情况提起刑事或民事诉讼。但关键在于要有充分的证据证明当时发生了犯罪行为或侵权行为，并且要在法律规定的时效期间内提起诉讼。因此，建议您或相关人士尽快咨询专业律师，了解具体的法律程序和操作建议。