结论：给员工购买意外险不能直接抵扣工伤保险中公司应承担的部分，二者性质不同、适用范围不同，不能相互替代或抵扣。以下从多个角度详细分析：

1. 法律性质不同

• 工伤保险：属于社会保险范畴，具有强制性。根据《工伤保险条例》，用人单位必须为员工缴纳工伤保险，费用由用人单位承担（部分地区个人也需承担少量费用）。工伤保险的目的是保障员工在工作过程中因工伤或职业病导致的医疗、康复、伤残、死亡等权益，由社保基金支付相关待遇。
• 意外险：属于商业保险范畴，具有自愿性。用人单位可以为员工购买意外险，但这是额外的福利，并非法定义务。意外险的保障范围通常包括工作内外因意外事故导致的伤害，赔偿标准由保险合同约定。

2. 赔偿范围与顺序不同

• 工伤保险：覆盖医疗费、康复费、伤残补助金、一次性工伤医疗补助金、一次性伤残就业补助金、丧葬补助金、供养亲属抚恤金等，具体标准由《工伤保险条例》规定。
• 意外险：赔偿范围取决于保险合同，通常包括意外身故、伤残、医疗费用等，但赔偿金额和条件可能与工伤保险不同。
• 关键点：即使员工获得意外险赔偿，也不影响其向用人单位或社保基金主张工伤保险待遇。用人单位不能以“已购买意外险”为由拒绝支付工伤保险应承担的部分。

3. 用人单位的法定义务不可免除

• 根据《社会保险法》和《工伤保险条例》，用人单位必须为员工缴纳工伤保险，这是法定义务。即使购买了意外险，也不能替代工伤保险的缴纳。
• 如果用人单位未缴纳工伤保险，员工发生工伤后，所有工伤保险待遇（包括本应由社保基金支付的部分）均由用人单位承担。此时，意外险的赔偿不能抵扣用人单位应承担的工伤保险待遇。

4. 实务中的操作建议

• 双重保障：用人单位可以同时为员工缴纳工伤保险和购买意外险，以提供更全面的保障。工伤保险覆盖法定范围，意外险作为补充，覆盖工作外的意外风险。
• 避免混淆：在劳动合同或员工手册中明确说明意外险的性质（如“额外福利”），避免员工误认为意外险可以替代工伤保险。
• 合规操作：确保按时足额缴纳工伤保险，避免因未缴费导致的高额赔偿风险。

5. 特殊情况：商业保险与工伤保险的衔接

• 如果意外险的赔偿项目与工伤保险重叠（如医疗费用），员工可以同时主张，但实际获得的总赔偿不得超过其实际损失（即“损失补偿原则”）。例如，医疗费用已通过意外险全额报销，则不能再通过工伤保险重复报销。
• 但伤残补助金、一次性工伤医疗补助金等属于工伤保险特有的待遇，意外险的赔偿不影响其主张。

总结：意外险不能直接抵扣工伤保险中公司应承担的部分。用人单位应依法缴纳工伤保险，同时可将意外险作为额外福利提供给员工，但需明确两者性质不同，避免法律风险。如有进一步疑问，欢迎继续向我咨询。