当与单位签有劳动协议，辞职时单位不同意，劳动者可以采取以下措施来维护自己的合法权益：
明确法定辞职权：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条，劳动者享有辞职权。只要提前三十日以书面形式通知用人单位（试用期内提前三日），即可解除劳动合同，无需征得用人单位的同意。这是法律赋予劳动者的基本权利，单位无权剥夺。
与单位进行沟通协商：
- 了解原因：首先，尝试与单位沟通，了解其不同意辞职的具体原因。可能是工作交接问题、招聘困难或其他特殊原因。
- 提出解决方案：针对单位提出的问题，可以主动提出解决方案，如协助工作交接、推荐合适人选或协商离职时间等，以减少单位的顾虑和损失。
- 保持冷静和专业：在沟通过程中，保持冷静和专业的态度，避免情绪化表达，清晰阐述自己的立场和理由，同时倾听单位的意见和需求。
采取后续行动：
- 正式提交书面辞职信：无论单位是否同意，都应按照法律规定，正式提交书面的辞职信，并保留好相关证据（如邮寄凭证、电子邮件记录等）。辞职信中应明确写明离职日期和离职原因。
- 继续履行工作职责：在离职前，仍需按照劳动合同和公司规定，认真履行工作职责，避免因旷工等行为给自己带来不必要的麻烦。
- 寻求法律援助或投诉：
- 如果单位存在违法行为，如拖欠工资、不办理离职手续等，可以向当地劳动监察部门投诉，请求调查并保护合法权益。
- 若与单位无法达成一致，且认为自身权益受到侵害，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。对仲裁结果不满意的，还可以向人民法院提起诉讼。
注意事项：
- 保护个人隐私和权益：在整个过程中，注意保护个人隐私和合法权益，避免泄露敏感信息或遭受不必要的骚扰。
- 避免违法行为：不要采取非法手段来迫使单位同意辞职，如擅自离职、破坏单位财产等，这些行为可能构成违法行为，需要承担相应的法律责任。
示例说明：
假设你是一名员工，与单位签订了为期一年的劳动合同。现在因个人原因想要辞职，但单位以工作交接困难为由不同意。你可以按照以下步骤操作：
- 首先，书写一封正式的辞职信，明确表达辞职意愿及离职日期（提前三十日），并通过邮寄挂号信或EMS等方式提交给单位，同时保留好送达凭证。
- 接着，与单位进行沟通，了解其具体顾虑，并提出协助工作交接或推荐合适人选等解决方案。
- 如果单位仍然不同意，你可以继续履行工作职责至离职日期，并在离职后向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
总结：当单位不同意辞职时，劳动者应首先明确自己的法定辞职权，并与单位进行沟通协商。若协商无果，则可采取后续行动，包括正式提交书面辞职信、继续履行工作职责、寻求法律援助或投诉等。在整个过程中，劳动者应保持冷静和理性，确保所有行动均合法合规。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。