结论前置：加班工资是否按基本工资计算需分情况讨论，若劳动合同或规章制度明确约定加班工资计算基数为基本工资且不低于当地最低工资标准，则合法；若未约定或约定违法（如低于最低工资），则不合法。遇到不合法情形时，可通过协商、投诉、仲裁或诉讼维权。以下是具体分析：

一、加班工资计算基数的合法性判断

根据《劳动法》第四十四条及《工资支付暂行规定》第十三条，加班工资的计算基数需满足以下条件：

1. 有约定从约定：若劳动合同或集体合同中明确约定加班工资计算基数（如“基本工资”），且该基数不低于当地最低工资标准，则合法。
   例如：员工基本工资3000元/月，当地最低工资2500元/月，约定按基本工资计算加班费，合法。

2. 无约定或约定违法：若未约定计算基数，或约定基数低于最低工资标准，则需以劳动合同约定的工资标准（如全额工资）或实际发放的工资（扣除非经常性奖金、补贴后）作为计算基数。
   例如：员工月工资8000元（含绩效2000元），合同未约定加班基数，若按基本工资3000元计算加班费，则违法。

3. 地方性规定优先：部分地区（如北京、上海）明确规定，加班工资计算基数不得低于劳动合同约定的工资标准或实际工资的70%。若地方规定与上述原则冲突，以地方规定为准。

二、维权步骤与建议

若发现单位未按合法标准支付加班工资，可按以下流程维权：

1. 收集证据

• 证明加班事实：考勤记录、加班审批单、工作邮件/聊天记录、同事证言等。
  
• 证明工资结构：劳动合同、工资条、银行流水（显示工资组成）、单位规章制度等。
  提示：若单位未提供工资条，可通过银行流水备注（如“工资+绩效”）或录音取证。

2. 与单位协商

• 书面提出异议：向单位发送《加班工资补发申请书》，明确计算基数及差额，要求限期补发。
  示例：“根据《劳动法》第四十四条，本人月工资8000元，但单位仅按3000元计算加班费，差额部分请于X日前补发。”

3. 投诉举报

• 向当地劳动监察大队投诉（可通过12333热线或官网提交材料），要求查处违法行为并责令补发。
  优势：处理周期短（一般60日内结案），适合金额较小或证据充分的案件。

4. 申请仲裁

• 若投诉未果，可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，主张：
  
  • 补发加班工资差额；
    
  • 50%-100%的赔偿金（若单位恶意拖欠）；
    
  • 解除劳动合同并要求经济补偿（若单位以此为由降薪或辞退）。
    流程：提交仲裁申请书、证据材料→仲裁庭开庭→裁决（一般45日内结案）。

5. 诉讼（可选）

• 对仲裁结果不服的，可在15日内向法院起诉。
  提示：诉讼周期较长（3-6个月），建议优先通过仲裁解决。

三、注意事项

1. 时效性：劳动争议申请仲裁的时效为1年，自知道或应当知道权利被侵害之日起计算。
   
2. 避免主动离职：若以单位未足额支付加班工资为由离职，需确保已履行“催告程序”（如书面要求补发），否则可能无法主张经济补偿。
   
3. 保密与安全：取证时注意保护个人信息，避免因维权被单位报复（如调岗、降薪）。

总结：加班工资是否按基本工资计算需结合合同约定、工资结构及地方规定综合判断。若单位违法，可通过协商、投诉、仲裁等途径维权，建议优先收集证据并咨询专业律师（即我）制定具体方案。