关于谅解书的钱由公司出还是司机出，这并非一个有固定答案的问题，而是需要根据具体情况来判断。以下是我从不同角度为你进行的分析：
从责任归属角度：
- 如果司机是在执行公司职务过程中发生的交通事故，且该事故被认定为司机的责任，那么根据《民法典》中关于用人单位责任的规定，公司作为用人单位可能需要承担相应的赔偿责任。在这种情况下，如果谅解书中的款项是为了解决交通事故引发的赔偿问题，那么公司可能会承担这部分费用。
- 如果事故是司机个人行为导致的，与职务无关，那么公司通常没有义务承担谅解书中的款项。此时，费用应由司机个人承担。
从合同约定角度：
- 如果公司与司机之间有明确的合同约定，比如劳动合同或雇佣协议中规定了事故处理费用的承担方式，那么应按照合同约定来执行。如果合同中约定公司承担此类费用，则公司需支付；如果约定司机承担，则司机需支付。
从实际协商角度：
- 在实际操作中，公司可能会出于维护企业形象、员工关系或避免法律纠纷等考虑，与司机协商共同承担谅解书中的款项。这种协商结果可能因公司政策、司机情况以及事故严重程度等多种因素而异。
法律建议：
- 对于公司而言，在处理此类问题时，应首先明确事故的责任归属，并查阅相关合同条款，以确定公司是否有义务承担费用。
- 如果公司决定承担费用，应确保有明确的内部审批流程，并保留好相关证据，以备未来可能的法律纠纷。
- 对于司机而言，如果事故是其个人责任，应主动承担相应费用，并与公司协商解决方案，以避免对公司造成不必要的负担或影响个人职业前景。
可能后果：
- 如果公司未经充分协商或未按照合同约定擅自承担费用，可能会引发内部管理问题或股东不满。
- 如果司机拒绝承担应由其个人承担的费用，公司可能会面临法律纠纷或需要采取法律手段追偿。
综上所述，谅解书的钱由公司出还是司机出，取决于事故责任归属、合同约定以及实际协商结果。在处理此类问题时，建议双方保持沟通，并寻求专业法律意见以确保合规性和公平性。如果你有更具体的情况或疑问，可以直接向我咨询。