善意取得虚开的增值税专用发票是否移送公安，需分情况讨论：

1. 若税务机关在检查中发现企业善意取得虚开发票，且未发现其他违法犯罪线索，一般不会直接移送公安机关
   根据《国家税务总局关于纳税人善意取得虚开的增值税专用发票处理问题的通知》（国税发〔2000〕187号），善意取得虚开发票的核心要件是：

   • 购货方与销售方存在真实交易；
     
   • 销售方使用的是其所在省（自治区、直辖市和计划单列市）的专用发票；
     
   • 专用发票注明的销售方名称、印章、货物数量、金额及税额等全部内容与实际相符；
     
   • 没有证据表明购货方知道销售方提供的专用发票是以非法手段获得的。
     若企业符合上述条件，税务机关通常仅要求补缴税款、滞纳金，不会直接移送公安机关。但需注意，税务机关可能将案件线索同步给公安部门，由公安部门决定是否立案侦查。

2. 若存在以下情形，即使企业主张“善意取得”，仍可能被移送公安机关：

   • 主观明知或应知：企业实际控制人、财务人员等明知交易对方无实际经营能力，或通过“资金回流”“虚假走账”等方式配合虚开，即使表面符合善意取得形式要件，仍可能被认定为恶意取得。
     
   • 涉及金额巨大或情节严重：根据《刑法》第二百零五条之一，虚开税款数额在10万元以上或造成国家税款损失5万元以上的，即达到刑事立案标准。若善意取得发票的税款金额或损失金额超过该标准，税务机关可能将案件移送公安。
     
   • 存在其他违法犯罪行为：如企业同时涉及骗取出口退税、贪污贿赂等犯罪，税务机关会依法移送公安机关联合侦查。

3. 企业如何降低风险？

   • 严格审核交易对方资质：通过国家企业信用信息公示系统等渠道核查供应商的经营范围、纳税信用等级，避免与“空壳公司”交易。
     
   • 规范资金流与货物流：确保付款账户与销售方一致，保留物流单据、仓储记录等证据，避免“资金回流”等异常现象。
     
   • 主动配合税务检查：若被认定为善意取得，需及时补缴税款及滞纳金，并提交交易合同、付款凭证等材料证明主观无过错。

总结：善意取得虚开发票是否移送公安，取决于企业是否符合善意取得要件、涉案金额及是否存在其他违法情节。企业应通过合规交易、留存证据等方式降低风险，若已涉案，建议尽快委托律师介入，分析交易细节，争取不构成犯罪或从轻处理。