专属管辖的案件，在一般情况下不能通过约定来选择仲裁作为争议解决方式，但在特定情形下，若法律未明确禁止且当事人达成有效仲裁协议，仍可能通过仲裁解决。以下是对这一问题的详细分析：
一、专属管辖的定义与特点
专属管辖是指法律强制规定某类案件只能由特定法院管辖，其他法院无管辖权，且当事人也不能协议变更管辖法院。这类案件通常涉及特定的地域或法律关系，如不动产纠纷、港口作业中发生的纠纷等。专属管辖的目的在于维护司法确定性和专业性，确保特定类型案件得到恰当处理。
二、仲裁的性质与适用
仲裁是一种双方自愿选择的争议解决方式，需要双方达成明确的仲裁协议，将争议提交给选定的仲裁机构进行裁决。仲裁具有自愿性、灵活性、专业性等特点，是当事人意思自治原则的体现。然而，仲裁的适用也受到法律的限制，并非所有类型的纠纷都可以通过仲裁解决。
三、专属管辖与仲裁的关系分析
一般原则：
- 专属管辖的案件具有排他性，一旦案件被确定为专属管辖，就排除了其他法院或仲裁机构的管辖权。因此，在一般情况下，当事人不能通过约定来选择仲裁作为专属管辖案件的争议解决方式。这种约定很可能是无效的，因为仲裁机构通常也不会接受违反专属管辖规定的仲裁申请。
特殊情形：
- 并非所有专属管辖的案件都绝对排除仲裁。例如，在建设工程施工合同纠纷中，虽然按照《中华人民共和国民事诉讼法》的规定，这类纠纷属于专属管辖，由不动产所在地人民法院管辖；但如果建设工程合同双方当事人在合同中约定了有效的仲裁条款，并且该约定不违反法律的强制性规定，那么当双方就合同履行等问题发生争议时，可以按照仲裁条款的约定，将纠纷提交给约定的仲裁机构进行仲裁。这体现了法律对当事人意思自治的尊重，但这种情况属于例外，并不普遍适用。
四、实际操作建议
明确案件类型与法律规定：
- 在处理专属管辖案件时，当事人应首先明确案件的具体类型和法律规定。如果案件确实属于专属管辖范围，且法律未明确允许通过仲裁解决，则应遵循法律规定的诉讼程序来解决争议。
审查仲裁条款的有效性与合法性：
- 如果案件存在特殊情形，如上述建设工程施工合同纠纷中的仲裁约定，当事人应仔细审查仲裁条款的有效性和合法性。确保仲裁条款不违反法律的强制性规定，且双方意思表示真实、明确。
咨询专业意见：
- 由于专属管辖与仲裁的关系复杂且涉及法律专业知识，当事人在处理此类问题时，如有疑问或不确定，可以直接向我咨询，我会根据具体案件情况和法律规定，为你提供准确的法律意见和帮助。
总结来说，专属管辖的案件在一般情况下不能通过约定来选择仲裁作为争议解决方式；但在特定情形下，如法律未明确禁止且当事人达成有效仲裁协议时，仍可能通过仲裁解决。因此，在实际操作中，当事人应根据具体案件情况和法律规定来选择合适的争议解决方式。