在受理申请的有效期内没有出具行政许可决定，而是发了一份告知函，这一行为是否违法，需分情况讨论：
如果告知函的内容是通知申请人行政许可决定已作出，并告知了相关结果：
- 在这种情况下，虽然行政机关没有在受理申请的有效期内直接出具行政许可决定书，但通过告知函的形式通知了申请人决定结果，这可以视为行政机关已经履行了其告知义务。只要行政机关在法定期限内完成了审批流程并作出了决定，且告知函的内容真实、准确、完整，那么这一行为通常不构成违法。不过，从规范行政程序的角度来看，行政机关最好还是直接出具行政许可决定书，以避免不必要的争议和误解。
如果告知函的内容是通知申请人行政许可决定尚未作出，或需要补充材料、进行进一步审查等：
- 在这种情况下，如果行政机关在受理申请的有效期内确实未能完成审批流程并作出决定，且告知函的内容符合法定程序和要求（如说明了延期的原因、需要补充的材料或进一步审查的内容等），那么这一行为通常也不构成违法。但行政机关应当尽快完成审批流程，并在作出决定后及时通知申请人。
- 然而，如果行政机关无正当理由在受理申请的有效期内未作出行政许可决定，且仅通过告知函的形式拖延或拒绝履行其职责，那么这一行为就可能构成违法。根据《中华人民共和国行政许可法》的相关规定，行政机关应当在法定期限内作出行政许可决定，否则申请人有权依法申请行政复议或提起行政诉讼。
关于告知函的合法性和有效性：
- 无论告知函的内容如何，其合法性和有效性都取决于是否符合法定程序和要求。例如，告知函应当明确、具体地说明相关事项，包括行政许可决定的进展情况、需要补充的材料或进一步审查的内容等。同时，告知函应当加盖行政机关的公章或专用章，以确保其真实性和权威性。
法律建议：
- 如果您作为申请人收到了行政机关的告知函，请仔细阅读其内容，并了解行政许可决定的进展情况。
- 如果您认为行政机关的行为构成违法或不当，您可以先与行政机关进行沟通协商，要求其尽快作出行政许可决定或给出合理的解释和说明。
- 如果沟通协商无果，您可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。
可能的后果：
- 如果行政机关的行为确实构成违法，那么其可能会面临行政复议机关或人民法院的撤销、变更或确认违法等判决，并可能需要承担相应的法律责任。
- 作为申请人，如果您因行政机关的违法行为而遭受了损失，您有权依法要求行政机关进行赔偿。
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