是否与纠纷较多的公司合作，不能一概而论，需根据具体情况综合评估后决定。以下从不同角度为您详细分析：
可以考虑合作的情况
案件性质与结果：
- 若公司的司法案件多为合同纠纷，且公司常作为原告积极维护自身权益，同时拥有完善的合同管理和风险防控机制，这通常表明公司在经营中注重法律合规和风险控制。例如，某公司因供应商违约而频繁提起诉讼，且多数胜诉，这显示了其较强的法律意识和维权能力。
- 如果公司在大部分案件中胜诉或达成对自身有利的结果，如通过调解获得合理赔偿，这显示出其在法律事务处理上的能力和优势，降低了合作风险。
行业特点：
- 某些行业，如建筑工程、知识产权密集型行业等，由于项目复杂、涉及金额大或法律环境特殊，司法案件相对较多。若公司案件数量与行业平均水平相当，且案件性质符合行业特点，如建筑工程行业因合同履行问题产生的纠纷，则不应仅因案件多而否定合作可能性。
公司经营及财务状况：
- 公司经营状况良好，财务稳健，如具有稳定的收入来源、健康的资产负债表和充足的现金流，则具备应对司法案件风险的能力。即使存在案件，也不太可能影响其合作能力和履约能力。例如，某科技公司虽涉及多起知识产权纠纷，但因其技术领先、市场占有率高，财务状况良好，仍被视为可靠的合作伙伴。
不建议合作的情况
严重违法违规案件：
- 如果公司涉及欺诈、非法集资、偷税漏税、商业贿赂等严重违法犯罪行为，这表明公司存在严重的诚信问题和违法经营行为。与其合作将带来极高的法律风险和商业风险，如可能因公司违法行为而遭受连带责任。
频繁败诉与高额赔偿：
- 公司在多数案件中败诉或频繁支付高额赔偿，可能意味着其在经营管理、合同履行、风险控制等方面存在重大问题。例如，某公司因产品质量问题多次被诉并败诉，需支付大量赔偿，这显示了其产品质量控制和风险管理的不足。这种情况下，合作的风险显著增加，应谨慎考虑。
公司信誉及形象受损：
- 大量的司法案件可能对公司的商业信誉和社会形象造成负面影响，如被媒体曝光为“诉讼大户”，影响其市场竞争力和合作伙伴的信任度。若公司因此在行业内口碑不佳，与其合作可能会面临市场风险和合作障碍，如客户流失、供应商拒绝合作等。
综合评估与合作决策建议
- 全面了解公司情况：在决定是否与公司合作时，应通过查阅公司公开信息（如年报、公告）、法律文书（如判决书、裁定书）、行业报告等方式，深入了解公司的经营状况、法律风险和信誉状况。
- 咨询专业意见：作为专业律师，我建议您在决策过程中咨询我的意见，以确保决策的合法性和合规性。我可以根据您的具体情况，提供针对性的法律分析和建议。
- 加强风险控制：在合作过程中，应加强合同管理、风险控制等措施，如签订详细的合作协议、明确双方的权利义务和违约责任、设置风险预警机制等，以确保双方权益得到有效保障。
综上所述，对于存在较多司法案件的公司，不能一概而论地拒绝合作或盲目接受。而是需要根据案件的性质、结果、行业特点以及公司的经营状况和信誉等多方面因素进行综合评估，以做出明智的决策。如果您在此过程中有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。