若法院已就变更法定代表人事项作出判决，可直接依据生效判决向公司登记机关申请办理变更登记，无需对方配合。具体操作流程及注意事项如下：

1. 确认判决效力与内容
   首先需确认法院判决已生效（一审判决需过上诉期且未上诉，或二审判决已作出），且判决中明确要求公司办理法定代表人变更登记。若判决仅确认“某主体不再担任法定代表人”而未明确变更义务，需进一步通过执行程序或补充判决明确登记义务主体（通常为公司）。

2. 准备申请材料
   根据《公司登记管理条例》及地方市场监管部门要求，通常需提交以下材料：

   • 生效判决书原件及复印件；
     
   • 公司签署的《公司登记（备案）申请书》（需加盖公司公章）；
     
   • 新任法定代表人的任职文件（如股东会决议、董事会决议等，需符合公司章程规定）；
     
   • 原法定代表人的免职证明（如判决已明确免职，可附判决书相关条款）；
     
   • 公司营业执照副本复印件。
     注：若公司拒不配合盖章或提供材料，可凭判决书直接向登记机关申请“强制变更登记”，部分地区支持通过司法执行程序直接办理。

3. 向登记机关申请变更
   携带上述材料至公司登记机关（通常为市场监督管理局）办理变更登记。若登记机关以“需公司配合”为由拒绝，可向其出示判决书并强调：

   • 法院判决已明确变更义务，登记机关有义务依据生效法律文书办理；
     
   • 若登记机关仍拒绝，可依据《行政诉讼法》对其行政不作为提起行政诉讼，要求其履行法定职责。

4. 执行程序辅助（如需）
   若公司拒不履行判决确定的义务（如拒不出具任职文件、拒不配合盖章），可向法院申请强制执行，由法院向公司发出《执行通知书》，要求其限期履行。若公司仍不履行，法院可对其采取罚款、拘留等强制措施，甚至通过司法拍卖、强制划转等手段处置公司财产以迫使履行。

5. 特殊情形处理

   • 公司已停业或被吊销：若公司处于非正常经营状态，需先通过解散清算、破产程序等解决公司主体资格问题，再办理法定代表人变更；
     
   • 原法定代表人拒不交接：可依据《公司法》第151条及判决书要求其限期交接公司证照、印章等，逾期可追究其侵权责任；
     
   • 新任法定代表人资格问题：需确保新任主体符合《公司法》第146条规定的任职资格（如无经济犯罪记录、未被列入失信名单等）。

建议：若对方持续阻挠且公司内部治理僵化，可同步考虑通过股东会决议修改公司章程，明确法定代表人产生及变更规则（如“法定代表人由董事长担任，董事长由控股股东委派”），从根源上减少对个别主体的依赖。如有进一步操作细节需确认，可直接向我咨询。