关于员工“自动离职”（在现行法律框架下，更准确的表述应为员工不辞而别或未按规定办理离职手续）需要办理的手续，这实际上涉及两个层面：一是员工应尽的义务和手续，二是用人单位应采取的措施和流程。以下我将从这两个方面为您详细解答。
员工应尽的义务和手续
提前通知：
- 尽管员工可能因各种原因选择不辞而别，但理论上，员工应按照劳动合同或公司规章制度的规定，提前一定时间（如30天）向用人单位提出离职申请，并说明离职原因和离职日期。
工作交接：
- 员工应确保将手头的工作、项目、文件、资料等完整、准确地交接给接替的同事或上级，确保工作的连续性和顺利进行。
- 交接过程中，应填写工作交接清单，明确交接事项、进度、联系人及后续工作开展情况，并由双方签字确认。
归还公司财物：
- 员工应归还所有属于公司的财物，如办公设备、工具、资料、门禁卡、工作证等。
结算工资和福利：
- 员工应与公司确认工资、奖金、福利等结算情况，确保无遗漏或争议。
- 如有需要，可与公司签订工资结算协议，明确已结算工资的明细和双方无薪酬异议。
用人单位应采取的措施和流程
尝试联系员工：
- 当员工出现不辞而别的情况时，用人单位应首先尝试通过电话、邮件、短信等方式联系员工，了解其离职原因和意愿，并要求其回来办理离职手续。
发送催告复工通知书：
- 如果联系不上员工或员工拒绝回来办理离职手续，用人单位可以向员工发送催告复工通知书，要求其在规定时间内回来复工或办理离职手续。
按照规章制度处理：
- 如果员工在规定时间内仍未回来复工或办理离职手续，用人单位可以按照公司规章制度的规定，以员工严重违反规章制度为由与其解除劳动关系。
- 在此过程中，用人单位应确保规章制度的合法性和合理性，并保留好相关证据，如催告复工通知书、员工未回复的记录等。
办理离职后续手续：
- 解除劳动关系后，用人单位应为员工办理档案、社保、公积金的封存或转移手续。
- 同时，依法为员工开具解除劳动合同证明，并告知其享受失业保险等相关权益。
防范类似行为：
- 为了防范员工不辞而别的行为，用人单位可以加强员工入职培训，明确离职流程和规定；完善公司规章制度，明确违反规定的后果；以及加强与员工的沟通和交流，及时了解员工的想法和需求。
综上所述，员工“自动离职”实际上涉及员工和用人单位双方的义务和流程。员工应尽量按照规定办理离职手续，而用人单位也应采取合理措施应对员工不辞而别的情况，并确保整个过程的合法性和合规性。