结论：公司员工同时在关联公司做事，没有与关联公司签订合同的情况下，工资是否可以分两块发放，这主要取决于关联公司之间的约定、员工与公司的实际用工关系以及相关法律法规的规定。以下从不同角度进行分析：
关联公司之间的约定与实际操作：
- 如果关联公司之间有明确的约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定，同时员工也知晓并同意这种工资发放方式，那么从实际操作的角度来看，工资分两块发放是可行的。但这种情况下，必须确保员工的合法权益不受损害，比如应确保员工能够按时足额收到工资，且工资水平不低于当地最低工资标准。
- 然而，如果关联公司之间没有明确的约定，或者约定不明确，那么这种工资发放方式就可能引发纠纷。员工可能会主张自己与两家公司都存在劳动关系，从而要求两家公司都承担支付工资的责任。
员工与公司的实际用工关系：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，用人单位自用工之日起即与劳动者建立劳动关系。如果员工同时在两家关联公司工作，但只与其中一家公司签订了劳动合同，那么员工与未签订劳动合同的公司之间可能构成事实劳动关系。
- 在事实劳动关系下，员工有权要求未签订劳动合同的公司支付工资、加班费、经济补偿等。因此，如果工资分两块发放，但其中一部分工资未得到员工的认可或未按时足额支付，员工就有可能通过法律途径维护自己的权益。
相关法律法规的规定：
- 工资支付应当遵循诚实信用、公平合理的原则，不得违反法律法规的强制性规定。如果工资分两块发放的方式违反了相关法律法规的规定，比如未按时足额支付工资、未支付加班费等，那么这种发放方式就是违法的。
- 此外，如果员工与两家公司都存在劳动关系，且两家公司都向员工支付了工资，那么员工可能需要就重复支付的工资部分进行退还或调整，以避免违反税法等相关法律法规的规定。
建议：
- 对于公司而言，为了避免潜在的劳动纠纷和法律风险，建议明确员工与关联公司之间的劳动关系和工资支付方式。如果员工同时在两家关联公司工作，最好与两家公司都签订劳动合同，并明确约定工资支付方式、工作时间、工作内容等关键条款。
- 对于员工而言，如果发现自己同时在两家关联公司工作但未与其中一家公司签订劳动合同，或者工资支付方式存在疑问或争议，建议及时与公司沟通协商，并保留好相关证据以便在必要时维护自己的权益。
可能后果：
- 如果工资分两块发放的方式引发纠纷，员工可能通过劳动仲裁或诉讼等途径要求公司支付未支付的工资、加班费、经济补偿等。
- 公司可能因违反相关法律法规的规定而面临行政处罚或民事赔偿等法律责任。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。