核心结论：承包工程未约定发票事宜，可通过协商补充约定、依据交易习惯或行业惯例处理，必要时可通过法律途径解决，同时需注意税务合规问题。以下是具体分析：

1. 协商补充约定
   首先，建议双方尽快就发票开具事宜进行协商，并签订补充协议明确约定。补充协议中应包括发票类型（如增值税专用发票或普通发票）、开具时间、税率、违约责任等内容。这是最直接且成本较低的解决方式，有助于避免后续纠纷。

2. 依据交易习惯或行业惯例处理
   若双方无法达成补充协议，可参考交易习惯或行业惯例。例如，建筑行业通常要求承包方在收到工程款后开具相应发票。若行业内有明确规定或惯例，可据此要求对方履行开票义务。但需注意，交易习惯或行业惯例需经双方认可或法院认定方可适用。

3. 通过法律途径解决
   若对方拒绝开票且协商无果，可考虑通过法律途径维护权益：

   • 起诉要求履行开票义务：根据《民法典》第五百九十九条，出卖人应当按照约定或者交易习惯向买受人交付提取标的物单证以外的有关单证和资料（包括发票）。若合同未约定但法律有规定，可要求对方履行。
     
   • 主张损失赔偿：若因对方未开票导致税款损失（如无法抵扣进项税），可要求对方赔偿实际损失。需提供税务机关出具的无法抵扣证明等证据。
     
   • 向税务机关举报：若对方存在偷逃税款行为，可向当地税务机关举报，由税务机关依法处理。

4. 税务合规注意事项
   无论通过何种方式解决，均需确保自身税务合规：

   • 付款时留存证据：支付工程款时，建议通过银行转账并备注款项性质（如“XX工程款”），避免现金交易。
     
   • 拒绝“白条”入账：未取得合法发票的支出，不得在企业所得税前扣除，可能面临税务风险。
     
   • 及时沟通税务问题：若对方坚持不开票，可明确告知其税务后果（如被税务机关处罚），促使对方配合。

建议行动步骤：

1. 立即与对方联系，书面要求其开具发票并设定合理期限；
   
2. 若对方拒绝，收集合同、付款凭证、沟通记录等证据；
   
3. 根据证据充分性，选择协商、诉讼或举报等方式解决；
   
4. 同步咨询税务专业人士，评估税务风险并制定应对方案。
   

如有进一步疑问或需具体操作指导，可直接向我咨询。