结论：公司被员工劳动仲裁输了，需要支付执行工资时，这部分工资仍然需要扣税。

详细解释：

1. 税收法定原则：

   • 根据我国的税收法律制度，个人所得税是针对个人所得进行征收的税种。工资、薪金所得属于个人所得税的征税范围，无论这笔工资是通过何种方式（如正常发放、劳动仲裁后执行等）获得，都需要依法缴纳个人所得税。

2. 劳动仲裁执行工资的性质：

   • 劳动仲裁后，公司需要支付给员工的工资，其性质仍然是员工的劳动报酬。因此，这部分工资同样受到个人所得税法的约束，需要按照税法规定进行扣税。

3. 扣税的具体操作：

   • 在实际操作中，公司作为工资的支付方，有义务按照税法规定代扣代缴员工的个人所得税。这意味着，在支付执行工资时，公司需要先计算出应缴纳的个人所得税额，并从工资总额中扣除这部分税款，然后再将剩余部分支付给员工。
   • 如果公司未按照规定代扣代缴个人所得税，可能会面临税务机关的处罚，包括但不限于罚款、滞纳金等。

4. 特殊情况说明：

   • 当然，也存在一些特殊情况，如员工因工伤获得的赔偿金等，这部分收入可能免征个人所得税。但劳动仲裁后支付的执行工资，并不属于这类免征个人所得税的范围。

建议：

• 对于公司而言，在支付执行工资时，务必按照税法规定代扣代缴个人所得税，以避免不必要的税务风险。
• 对于员工而言，如果对公司代扣代缴的个人所得税额有疑问，可以向公司咨询或向税务机关查询，以确保自己的权益得到保障。

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