建设单位以审计为由不付款，施工单位可采取以下措施维护自身权益：

1. 核查合同条款，明确付款条件
   首先需审查施工合同中关于“工程款支付”和“审计条款”的具体约定。若合同明确约定“审计完成作为付款前提”，则需进一步分析审计条款的合理性（如审计期限、审计机构选定方式等）；若合同未将审计作为付款条件，或仅约定“以审计结果作为结算依据”，则建设单位不得以审计未完成为由拒绝付款，施工单位可直接依据已完成工程量主张进度款或结算款。

2. 区分“审计”与“结算”，打破付款僵局
   实践中，建设单位常混淆“审计”与“结算”概念。根据《建设工程价款结算暂行办法》，工程结算是指发承包双方根据合同约定，对合同价款进行计算和确认的过程，而审计是建设单位或其委托的第三方对结算结果的复核。若合同未约定“审计完成才付款”，施工单位完成结算文件提交后，建设单位应在合同约定期限内（如28天）完成审核，逾期未回复视为认可结算金额，施工单位可据此主张付款。

3. 发送书面催告，固定证据链
   若建设单位以审计为由拖延付款，施工单位应立即发送《催款函》，明确要求其在合理期限内（如15日）支付款项，并附上已完成工程量证明、结算文件、合同条款等证据。若建设单位仍不支付，可进一步发送《律师函》，阐明其违约行为及法律后果（如逾期付款利息、违约金等），为后续诉讼或仲裁做准备。

4. 启动争议解决程序，主张优先受偿权
   若协商无果，施工单位可根据合同约定向仲裁机构申请仲裁或向法院起诉。诉讼中，可同时主张：

   • 要求建设单位支付工程款及逾期利息（按LPR计算）；
     
   • 若工程已竣工，主张建设工程价款优先受偿权（需在竣工之日起6个月内行使）；
     
   • 若建设单位存在恶意拖延审计，可主张其承担违约责任（如合同约定的违约金或实际损失）。

5. 警惕“以审代结”条款，提前防范风险
   为避免类似纠纷，施工单位在签订合同时应注意：

   • 明确审计期限（如“审计应在结算文件提交后60日内完成”），逾期视为认可结算金额；
     
   • 限制审计机构选定方式（如双方共同委托或由施工单位推荐）；
     
   • 约定“审计结果与结算金额差异超过5%时，以结算金额为准”等条款，防止建设单位滥用审计权。

行动建议：立即整理合同、结算文件、催款记录等证据，向建设单位发送书面催告函；若仍无进展，尽快启动法律程序，避免超过诉讼时效或优先受偿权行使期限。如有具体合同条款或证据材料，可进一步向我咨询，我将为您制定详细维权方案。