结论：业委会印章和业主大会印章都由业委会主任保管，这一做法的合法性不能一概而论，需结合具体情况和相关规定来判断。

分析说明：

1. 从印章管理的一般原则来看：

   • 印章作为代表组织意志的重要凭证，其管理应当遵循严格的规定，以确保印章使用的合法性和安全性。
   • 通常，印章的管理应由专人负责，且该负责人应具备一定的职责和权限，同时应建立印章使用登记制度，对印章的使用情况进行详细记录。

2. 从业委会和业主大会的职能来看：

   • 业委会是业主大会的执行机构，负责处理业主大会的日常事务。
   • 业主大会则是业主共同决定物业区域内重大事项的机构。
   • 业委会印章和业主大会印章分别代表业委会和业主大会的意志，其使用应严格区分，避免混淆。

3. 关于印章由主任一人保管的合法性：

   • 若符合规定：如果业委会或业主大会的章程、规定或相关法律法规明确允许或未禁止业委会主任同时保管两枚印章，且该主任在保管过程中能够严格遵守印章使用规定，确保印章使用的合法性和安全性，那么这种做法可能是合法的。
   • 若不符合规定：如果业委会或业主大会的章程、规定或相关法律法规明确禁止业委会主任同时保管两枚印章，或者该主任在保管过程中存在滥用印章、违规使用印章等行为，那么这种做法就是不合法的。

法律建议：

• 审查相关规定：首先，应审查业委会和业主大会的章程、规定以及相关法律法规，明确关于印章管理的具体要求。
• 建立印章管理制度：如果尚未建立印章管理制度，建议尽快建立，明确印章的保管、使用、登记等流程，确保印章使用的合法性和安全性。
• 加强监督与制约：即使业委会主任同时保管两枚印章，也应建立有效的监督与制约机制，如定期审计印章使用情况、设立印章使用审批流程等，以防止滥用印章或违规使用印章。

后续行动建议：

• 如果您对业委会或业主大会的印章管理存在疑虑或担忧，建议及时与业委会成员沟通，共同商讨解决方案。
• 如果发现业委会主任在保管或使用印章过程中存在违法行为或违规行为，可以向相关部门举报或寻求法律援助。

如有任何进一步的问题或需要更具体的法律建议，请随时向我咨询。