结论：是否需要开发票取决于车位抵充行为的性质，若属于销售或转让车位，通常需要开具发票；若属于债务抵消等非销售行为，则可能不需要。以下分情况详细说明：

1. 若车位抵充属于销售或转让行为
   根据《中华人民共和国发票管理办法》第十九条，销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，对外发生经营业务收取款项，收款方应当向付款方开具发票。因此，如果甲方将车位抵充给乙方是作为销售或转让车位的一部分，且乙方需要支付对价（如抵消债务外的差价），则甲方应当向乙方开具发票。这既是甲方的法定义务，也是乙方后续办理车位产权登记、缴纳税费等手续的必要凭证。

2. 若车位抵充属于债务抵消行为
   如果甲方与乙方之间存在债权债务关系，甲方用车位抵充债务（即“以物抵债”），且双方约定无需额外支付对价，则该行为可能不涉及发票开具。因为此时车位的交付本质上是债务的清偿，而非销售或转让。但需注意，若车位抵充后乙方需办理产权过户手续，可能涉及契税、增值税等税费，此时税务机关可能要求提供相关凭证（如抵债协议、评估报告等），但不一定是发票。

3. 特殊情形：车位为赠与或无偿转让
   如果甲方将车位无偿赠与乙方（如亲属间的赠与），根据《增值税暂行条例》及实施细则，个人无偿转让不动产可能免征增值税，但需办理免税手续。此时通常无需开具发票，但需签订赠与合同并办理公证、产权过户等手续。若涉及企业间的无偿转让，则可能被税务机关认定为视同销售，需缴纳增值税并开具发票。

建议：

• 双方应明确车位抵充的性质（销售、债务抵消还是赠与），并在协议中约定是否开具发票及税费承担方式。
  
• 若涉及产权过户，建议提前咨询当地税务机关或不动产登记中心，了解具体手续和凭证要求。
  
• 若对税务处理存在疑问，可进一步向我咨询，我会结合具体情形提供更详细的法律意见。