结论：在甲方用车抵工程款的情况下，乙方是否需要开具专票给甲方，主要取决于双方之间的约定以及具体的交易性质，但通常情况下，若该交易被视为销售行为，乙方应开具专票。
分析：
交易性质：
- 当甲方用车抵工程款时，这一行为在本质上可能被视为一种销售或转让行为，即乙方从甲方处获得了车辆作为工程款的支付。如果这种交易被税务机关认定为销售行为，那么乙方作为销售方，就有义务按照税法规定开具增值税专用发票（专票）。
双方约定：
- 双方之间的合同或协议是确定各自权利和义务的重要依据。如果合同中明确规定了乙方在收到车辆作为工程款支付时需要开具专票，那么乙方就必须遵守这一约定。
- 如果合同中没有明确规定，但双方在实际操作中形成了开具专票的惯例，或者甲方明确要求乙方开具专票，乙方也应考虑满足这一要求，以避免潜在的税务风险和法律纠纷。
税务法规：
- 根据相关的税务法规，销售方在发生销售行为时，通常需要向购买方开具增值税专用发票。这是为了确保税收的合法性和准确性，同时也是购买方进行税务抵扣的重要依据。
- 如果乙方未按照规定开具专票，可能会面临税务机关的处罚，包括罚款、滞纳金等，甚至可能影响乙方的税务信用等级。
建议：
- 明确约定：在未来的合同中，双方应明确约定在用车抵工程款的情况下，乙方是否需要开具专票，以及开具专票的具体要求和流程。
- 咨询税务机关：如果双方对税务法规的理解存在疑问，或者对交易性质是否属于销售行为存在争议，建议咨询当地税务机关以获取明确的指导。
- 保留证据：无论是否需要开具专票，双方都应保留好相关的交易证据，如合同、协议、车辆转让证明等，以备不时之需。
可能的法律后果：
- 如果乙方未按照规定开具专票，且该交易被税务机关认定为销售行为，乙方可能会面临税务机关的处罚，包括但不限于罚款、滞纳金等。
- 如果因未开具专票而导致甲方无法进行税务抵扣，甲方可能会要求乙方承担相应的损失赔偿责任。
因此，在甲方用车抵工程款的情况下，乙方应谨慎处理开具专票的问题，确保符合税法规定和双方约定。如果有任何疑问或不确定的地方，建议直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见。