结论：员工未经公司许可擅自请假，通常被视为旷工行为，这不仅违反了公司的规章制度和劳动纪律，还可能对公司和员工自身产生一系列法律后果。公司有权依据法律和规章制度采取相应处理措施，而员工也需承担相应的责任。以下是对此问题的详细分析：
一、对员工的影响及责任
违反公司规章制度：
- 公司可能会根据情节轻重给予警告、罚款、降职降薪、甚至解除劳动合同等处罚。
- 多次或严重违规可能导致职业声誉受损，影响个人在公司内部的职业发展。
- 员工可能因此失去某些权益，如全勤奖、年度绩效评估奖金、带薪年假等。
法律责任：
- 如果员工的擅自休假行为给公司造成了实际经济损失，且公司能提供充分证据，员工需承担赔偿责任。
- 在极端情况下，如果员工的行为构成严重违反用人单位规章制度，公司有权依据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条第二项的规定解除劳动合同，即劳动者严重违反用人单位的规章制度的，用人单位可以解除劳动合同，且可能无需支付经济补偿。
争议处理：
- 员工若对公司的处理措施有异议，可通过劳动仲裁或法院诉讼的方式维护自己的权益，但需确保遵循法律法规和公司规章制度的要求。
二、对公司的影响及处理措施
工作延误和混乱：
- 员工擅自休假可能导致工作任务无法按时完成，打乱团队协作节奏，给其他同事带来额外负担，影响项目或业务的推进。
法律风险：
- 公司需确保处理措施合法合规，避免随意克扣工资或违法解除劳动合同，以免引发劳动纠纷。
- 如果处理不当，公司可能面临支付赔偿金、恢复劳动关系等法律责任。
处理措施：
- 公司应当以书面形式向员工送达通知书，限定其在指定时间内回公司上班，并明确提出如限期内不上班将采取的处理措施。
- 如员工未按要求回公司上班，公司可将其行为视为旷工，并依据相关法律法规和公司规章制度采取进一步措施，如解除劳动合同等。
三、特殊情况考虑
- 在某些特殊情况下，如员工因紧急情况或不可抗力事件无法提前请假，公司应当根据实际情况进行判断和处理，给予一定的宽限或特殊处理。例如，员工突发疾病或遭遇意外事故，无法及时请假，公司应考虑员工的实际情况，给予合理的理解和处理。
四、总结与建议
- 员工：应严格遵守公司的请假流程和审批制度，如有正当理由需要请假，应及时按照规定提交申请和相关证明材料。避免未经公司许可擅自请假，以免给自己和公司带来不必要的麻烦和损失。
- 公司：应确保规章制度的制定符合法律规定，并在处理类似问题时遵循法定程序。同时，加强内部管理，确保员工了解并遵守相关规章制度，减少类似纠纷的发生。
最后，无论是员工还是公司，都应充分了解未经公司许可擅自请假的法律后果，并采取相应措施以避免不必要的争议和纠纷。如果你或你的公司遇到此类问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。