结论：员工私自挪用公司资金，即使已经还款，公司仍然有权起诉。是否起诉以及起诉的具体法律后果，需根据挪用资金的具体情况、数额、时间以及是否构成犯罪等因素综合判断。

详细分析：

1. 民事责任角度：

   • 员工私自挪用公司资金，无论是否已经还款，都构成了对公司财产权的侵害。公司作为财产的所有者，有权要求员工承担民事责任，包括赔偿损失等。
   • 即使员工已经还款，但如果挪用行为给公司造成了其他损失（如利息损失、交易机会丧失等），公司仍然可以要求员工进行赔偿。

2. 刑事责任角度：

   • 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，员工私自挪用公司资金，如果数额较大、超过三个月未还，或者虽未超过三个月但数额较大、进行营利活动，或者进行非法活动，都可能构成挪用资金罪。
   • 一旦构成犯罪，无论员工是否已经还款，都可能面临刑事处罚，包括有期徒刑、拘役、罚金等。公司作为受害者，可以向公安机关报案，要求追究员工的刑事责任。

3. 具体法律后果的考量：

   • 挪用资金数额：数额的大小是判断是否构成犯罪以及量刑轻重的重要因素。一般来说，数额越大，法律后果越严重。
   • 挪用时间：如果挪用资金超过三个月未还，或者虽然未超过三个月但用于营利活动或非法活动，都可能加重法律后果。
   • 是否构成犯罪：如果挪用行为不构成犯罪，公司可能只能通过民事途径追究员工的责任；如果构成犯罪，则员工可能面临刑事处罚。

4. 公司的选择：

   • 公司可以根据自身情况和挪用资金的具体情况，选择是否起诉员工。如果挪用行为情节轻微，公司可能选择内部处理或要求员工赔偿损失；如果情节严重，公司则可能选择向公安机关报案，要求追究员工的刑事责任。

建议：

• 如果公司发现员工有私自挪用资金的行为，无论是否已经还款，都应及时收集证据，包括资金流水、转账记录、员工陈述等，以便在需要时维护自身权益。
• 公司可以根据挪用资金的具体情况，咨询专业律师的意见，以制定合适的应对策略。
• 如果决定起诉员工，公司应准备好相关证据材料，并按照法律程序进行操作。

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