针对“违章建筑人已居住好几年了该怎么处理”这一问题，核心结论需分情况讨论，主要取决于违章建筑的性质、当地政策及是否涉及公共利益等因素，具体分析如下：

1. 若违章建筑未被相关部门认定为必须拆除的
   根据《城乡规划法》第六十四条，未取得建设工程规划许可证的建筑，若可采取改正措施消除对规划实施的影响（如补办手续、调整规划等），相关部门会责令限期改正，并处建设工程造价5%-10%的罚款。此时，居住者需配合补办手续（如土地使用证、规划许可证等），若符合条件，建筑可能被合法化，居住行为得以继续。

2. 若违章建筑被认定为必须拆除的
   若建筑严重影响城乡规划（如占用公共道路、绿地、消防通道等），或无法通过改正措施消除影响，相关部门会责令限期拆除。根据《行政强制法》第四十四条，拆除前需履行催告、公告程序，若居住者拒不拆除，政府可依法强制执行。此时，居住者需在限期内自行搬离，否则可能面临强制清退及物品损失风险。

3. 若涉及历史遗留问题或特殊政策
   部分地区对早期形成的违章建筑（如2008年《城乡规划法》实施前建设的）可能采取“分类处置”政策，如通过罚款、补办手续等方式逐步合法化，或纳入旧城改造范围协商补偿。此时，居住者需关注当地政策动态，主动与规划、城管部门沟通，争取合理解决方案。

建议行动步骤：

• 第一步：确认建筑性质（是否占用公共空间、是否影响安全等），可通过当地规划局或城管部门查询；
  
• 第二步：若建筑有合法化可能，尽快补办手续（如土地使用证、规划许可证）；
  
• 第三步：若面临拆除，及时与相关部门协商补偿方案（如搬迁补助、临时安置费等），避免强制执行导致损失扩大；
  
• 第四步：若对处理结果有异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼，维护自身权益。
  

温馨提示：违章建筑存在法律风险（如被强制拆除、罚款等），建议优先通过合法途径解决。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程。