案件事实不清的情况下，是可以进行调解的。以下从不同角度为你详细分析：
调解的法律依据与原则
调解作为一种纠纷解决方式，其核心在于双方当事人的自愿与合意。根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释，调解贯穿于民事诉讼的全过程，包括一审、二审和再审阶段。调解的原则包括自愿、合法、平等、尊重当事人诉讼权利等。这些原则为调解在案件事实不清情况下的应用提供了法律基础。
案件事实不清对调解的影响
调解的灵活性：调解并不严格要求案件事实必须完全清晰。在事实不清的情况下，双方当事人可以通过协商，就争议事项达成妥协。这种妥协可能基于对未来风险的评估、对诉讼成本的考量，或者是对双方关系的维护等多种因素。
调解的效率性：与诉讼相比，调解通常更为迅速和高效。在案件事实不清的情况下，如果通过诉讼解决，可能需要经过漫长的调查、取证和审理过程。而调解则可以在双方自愿的基础上，快速达成协议，节省时间和资源。
调解的保密性：调解过程通常不公开进行，这有助于保护当事人的隐私和商业秘密。在案件事实不清的情况下，调解可以避免敏感信息的泄露，减少对当事人声誉和利益的损害。
案件事实不清时调解的注意事项
确保自愿性：在调解过程中，必须确保双方当事人的自愿性。任何一方都不应在受到胁迫或欺诈的情况下达成调解协议。如果一方对调解协议的内容存在疑虑或不满，应及时提出并寻求解决。
合法性审查：虽然调解不严格要求案件事实必须完全清晰，但调解协议的内容必须合法。调解协议不得违反法律、行政法规的强制性规定，不得损害国家、集体或第三人的利益。
明确协议内容：在调解协议中，应明确双方的权利和义务，以及协议的具体履行方式和期限。这有助于避免未来因协议内容不明确而产生的纠纷。
调解与诉讼的衔接
如果调解未能达成协议，或者调解协议达成后一方不履行，另一方仍然有权向法院提起诉讼。在诉讼过程中，法院将依法对案件进行审理，并根据查明的事实作出判决。因此，调解并不排除诉讼的可能性，而是为当事人提供了一种更为灵活和高效的纠纷解决方式。
总结与建议：
案件事实不清并不妨碍调解的进行。在调解过程中，应确保双方当事人的自愿性、合法性审查以及明确协议内容。如果调解未能达成协议或调解协议未能履行，当事人仍然有权向法院提起诉讼。如果你面临案件事实不清的情况，并考虑通过调解解决纠纷，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。