结论前置：农民工工资扣除20%并没有一个普遍适用的法律依据，是否可以扣除以及扣除的比例需根据具体情况和相关法律法规来判断。以下是从不同角度进行的分析：

1. 劳动合同或集体合同的约定：

   • 如果农民工与用人单位在劳动合同或集体合同中明确约定了工资扣除的具体情形和比例，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位在符合约定条件的情况下，可以按照约定扣除农民工的工资。但扣除20%的比例是否合理，需结合具体约定和实际情况来判断。

2. 法律法规的规定：

   • 一般情况下，法律法规并不会直接规定用人单位可以扣除农民工工资的具体比例。但《工资支付暂行规定》等法规对工资支付、扣除等事项有原则性规定，如用人单位不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。若用人单位因农民工过错（如严重违反规章制度、造成重大损失等）需要扣除工资，也应遵循合法、合理、公平的原则，且扣除后的工资不得低于当地最低工资标准。
   • 特殊情况：如果农民工因自身原因（如旷工、迟到早退等）给用人单位造成损失，用人单位在按照劳动合同或规章制度扣除工资时，也应确保扣除的比例和金额合理，且扣除后的工资不低于最低工资标准。但即便如此，扣除20%的比例也可能因过高而引发争议，需结合具体情况判断。

3. 地方性法规或政策：

   • 不同地区可能根据当地实际情况制定了地方性法规或政策，对农民工工资扣除等事项作出具体规定。因此，在判断农民工工资扣除20%是否合法时，还需考虑当地的地方性法规或政策。

4. 实际操作中的建议：

   • 对于农民工而言，如果发现用人单位无故扣除工资或扣除比例过高，应及时与用人单位沟通协商，要求用人单位说明扣除的依据和理由。
   • 如果协商无果，农民工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
   • 对于用人单位而言，应严格遵守法律法规和劳动合同、集体合同的约定，合理、合法地扣除农民工工资，避免引发劳动争议和法律风险。

进一步思考：在实际操作中，农民工工资扣除问题往往涉及复杂的法律关系和事实认定。因此，在处理此类问题时，建议农民工和用人单位都咨询专业律师或法律机构，以确保自己的权益得到妥善维护。如果你有任何关于劳动工伤（工资福利）方面的法律问题，可以直接向我咨询。