在职务侵占案件中，如果对方已经出具了谅解书，这份谅解书通常需要提交给司法机关，具体来说是公安机关、检察院或法院，具体取决于案件所处的阶段。以下是对这一问题的详细解答：

一、谅解书的作用与意义

谅解书是刑事案件中被害人或其家属对犯罪嫌疑人或被告人的行为表示谅解，并请求司法机关从轻、减轻或免除处罚的书面文件。在职务侵占案件中，谅解书对于犯罪嫌疑人或被告人来说，是一个重要的量刑情节，可能对其最终的刑罚产生积极影响。

二、谅解书的提交时机与对象

1. 案件侦查阶段：

   • 如果案件仍处于公安机关的侦查阶段，谅解书可以提交给公安机关。公安机关在收到谅解书后，会将其作为案件材料的一部分，随案移送至检察院。

2. 案件审查起诉阶段：

   • 如果案件已经进入检察院的审查起诉阶段，谅解书可以直接提交给检察院。检察院在审查案件时，会考虑谅解书对犯罪嫌疑人或被告人量刑的影响。

3. 案件审判阶段：

   • 如果案件已经进入法院的审判阶段，谅解书可以提交给法院。法院在审理案件时，会将谅解书作为量刑的参考依据之一。

三、提交谅解书的注意事项

1. 谅解书的真实性：

   • 谅解书必须真实反映被害人或其家属的意愿，不得伪造或篡改。否则，一旦被发现，将可能对犯罪嫌疑人或被告人产生不利的法律后果。

2. 谅解书的完整性：

   • 谅解书应包含被害人或其家属的签名、日期、联系方式等必要信息，以确保其法律效力。

3. 与司法机关的沟通：

   • 在提交谅解书前，建议与司法机关进行沟通，了解具体的提交要求和程序。这有助于确保谅解书能够顺利被接收并作为案件材料的一部分。

四、谅解书对量刑的影响

虽然谅解书不是法定的量刑情节，但它在司法实践中往往被视为一个重要的酌定量刑情节。如果被害人或其家属出具了谅解书，并请求司法机关从轻、减轻或免除处罚，司法机关在量刑时会予以充分考虑。然而，具体的影响程度还需根据案件的具体情况、犯罪嫌疑人或被告人的认罪态度、悔罪表现等因素综合判断。

总结来说，在职务侵占案件中，如果对方已经出具了谅解书，这份谅解书应根据案件所处的阶段提交给相应的司法机关（公安机关、检察院或法院）。在提交时，应确保谅解书的真实性和完整性，并与司法机关进行沟通以了解具体的提交要求和程序。如果你还有其他关于职务侵占案件或刑事辩护的问题，可以直接向我咨询。