结论：股东签订的合同如果法人不认可，其合同效力及后续处理需依据具体情况进行法律分析。以下是从不同角度对这一问题的详细解答：
一、合同效力分析
通常情况合同有效：
- 根据《民法典》的相关规定，法定代表人以法人名义从事的民事活动，其法律后果由法人承受。因此，当法人（即公司的法定代表人）签字并加盖公司公章时，该合同一般被视为代表了法人的真实意思表示，合同自成立时生效，对法人具有法律约束力。
- 即便股东会不认可，也不影响合同在外部的效力。合同相对方有权要求法人按照合同约定履行义务。例如，如果股东签订了一份采购合同，法人签字并加盖了公章，即使部分股东不认可，供应商仍有权要求公司按照合同约定支付货款。
特殊情形合同可能无效或可撤销：
- 如果法定代表人超越权限订立合同，且相对人知道或者应当知道其超越权限，该代表行为可能无效。例如，公司章程明确规定某些重大合同必须经过股东会决议通过，而法定代表人未经授权擅自签订，且相对人在签订合同时知晓此规定，那么该合同可能被视为无效。
- 如果存在欺诈、胁迫等情形，受损害方有权请求人民法院或仲裁机构撤销合同。比如，如果法定代表人通过欺诈手段诱使股东签订了一份对公司不利的合同，股东在发现后有权请求撤销该合同。
二、股东会的救济途径与内部管理
内部追责：
- 股东会可以依据公司章程和相关法律法规追究法定代表人的责任。如果法定代表人的行为给公司造成了损失，公司有权要求其承担赔偿责任。例如，如果法定代表人未经授权签订了一份导致公司损失惨重的合同，股东会可以要求其赔偿公司的损失。
完善内部管理：
- 为防止类似情况再次发生，股东会可以通过修改公司章程、制定更严格的合同审批流程等方式，加强对法定代表人权力的约束。比如，可以规定超过一定金额或涉及特定事项的合同必须经过股东会或董事会审议通过，以确保合同的合法性和有效性。
三、对合同相对人的影响
善意相对人权益受保护：
- 如果合同相对人是善意的，即不知道且不应当知道法定代表人超越权限，那么根据法律规定，该合同有效，相对人可以要求法人履行合同义务。即使法人内部存在争议，也不能对抗善意相对人。例如，供应商在签订合同时并不知道法定代表人超越了权限，且供应商是善意的，那么供应商仍有权要求公司按照合同约定支付货款。
相对人存在过错的情况：
- 如果相对人知道或者应当知道法定代表人超越权限而与之签订合同，在合同被认定无效或被撤销后，相对人可能需要承担相应的法律责任，如返还因合同取得的财产等。比如，如果供应商在签订合同时知道法定代表人超越了权限，但仍然与之签订了合同，那么在合同被认定无效后，供应商可能需要返还公司已经支付的货款。
四、实际操作建议
加强沟通：
- 在签订合同前，股东之间应加强沟通，确保对合同内容达成一致意见。如果可能的话，可以召开股东会或董事会进行审议和决策，以避免后续出现争议。
明确权限：
- 公司应明确法定代表人的权限和职责，并在公司章程或相关管理制度中予以规定。这样可以避免法定代表人超越权限签订合同的情况发生。
咨询专业律师：
- 在签署重要合同前，建议公司咨询专业律师的意见，以确保合同的合法性和有效性。律师可以对合同条款进行审查，提供法律建议，并帮助公司规避潜在的法律风险。
最后，股东签订的合同如果法人不认可，其合同效力及后续处理需依据具体情况进行法律分析。如果遇到相关问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。