如果股东已经履行了出资义务，但公司却不认可，这通常涉及到股东与公司之间的权益纠纷。针对这种情况，以下是我作为专业律师给出的详细解答和建议：
首先，明确结论：股东在履行出资义务后，若公司不认可，股东有权采取一系列法律措施来维护自己的合法权益，包括但不限于与公司协商、寻求股东会或董事会决议、提起民事诉讼等。
接下来，具体分析：
与公司协商：
- 股东应首先与公司管理层或相关负责人进行沟通，了解公司不认可出资的具体原因，并尝试通过协商解决纠纷。
- 在协商过程中，股东可以出示出资证明、银行转账记录、验资报告等证据，以证明自己已经履行了出资义务。
寻求股东会或董事会决议：
- 如果与公司协商无果，股东可以提议召开股东会或董事会，将出资纠纷作为议题进行讨论，并寻求决议。
- 股东会或董事会决议可以作为解决纠纷的重要依据，如果决议支持股东已经履行出资义务，那么公司应当据此认可股东的出资。
提起民事诉讼：
- 如果股东会或董事会无法解决问题，或者公司拒绝执行相关决议，股东有权向人民法院提起民事诉讼。
- 在诉讼过程中，股东需要提交充分的证据证明自己已经履行了出资义务，并请求法院判决公司认可其出资、赔偿损失等。
法律后果：
- 如果法院最终判决支持股东的主张，公司不仅需要认可股东的出资，还可能需要承担因纠纷产生的诉讼费用、赔偿损失等法律责任。
- 同时，公司的信誉和声誉也可能因此受到影响，对未来的经营和发展产生不利影响。
最后，给出建议：
- 股东在履行出资义务时，应确保出资程序合法、出资证据完备，以避免后续纠纷。
- 在与公司协商或提起诉讼前，股东可以寻求专业律师的法律咨询和帮助，以更好地维护自己的合法权益。
- 如果纠纷涉及复杂的法律问题和大量的证据材料，建议股东聘请专业律师代理诉讼，以提高胜诉的可能性。
总之，作为股东，在履行出资义务后遭遇公司不认可的情况时，应保持冷静、理性应对，并依法采取合适的措施来维护自己的合法权益。