结论：老板因员工打架罚一个人两百元并扣除年终奖是否合理，需分情况讨论，主要取决于公司规章制度、劳动合同的约定以及罚款和扣奖金的合法性。
一、罚款两百元的合理性分析
公司规章制度与劳动合同：
- 如果公司的规章制度中明确规定了员工打架等违纪行为的处罚措施，包括罚款，并且该规章制度已经通过合法程序（如职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定）制定并公示，同时员工在签订劳动合同时也已知悉并同意，那么公司依据规章制度对员工进行罚款是合法的。
- 如果公司规章制度或劳动合同中没有相关规定，或者规定不明确，那么公司单方面对员工进行罚款可能缺乏法律依据。
罚款的合法性：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律法规，用人单位不得随意对员工进行罚款，除非有明确的规章制度或劳动合同约定，并且罚款的数额应当合理，不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。
- 如果罚款数额过高或违反上述规定，员工有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
二、扣除年终奖的合理性分析
年终奖的性质：
- 年终奖是用人单位根据自身经营状况和员工表现，在年底向员工发放的额外奖励，属于劳动报酬的一部分，但并非法定必须支付的。
- 年终奖的发放通常与员工的工作表现、公司业绩等因素挂钩，具体发放标准和条件由用人单位自行决定。
扣除年终奖的合法性：
- 如果公司的规章制度或劳动合同中明确规定了员工违纪行为（如打架）将导致年终奖的扣除，并且该规定已经通过合法程序制定并公示，员工已知悉并同意，那么公司扣除年终奖可能是合法的。
- 如果公司规章制度或劳动合同中没有相关规定，或者规定不明确，那么公司单方面扣除年终奖可能缺乏法律依据。员工可以依据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的规定，向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司支付被扣除的年终奖。
三、建议与行动
审查公司规章制度与劳动合同：
- 员工应首先审查公司的规章制度和劳动合同，了解其中关于违纪行为的处罚措施和年终奖的发放条件。
与公司沟通协商：
- 如果员工认为公司的处罚措施不合理或违法，可以与公司进行沟通协商，寻求解决方案。
寻求法律援助：
- 如果沟通协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
最后，每个具体情况都可能有所不同，如果你或他人遇到类似问题，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供更详细的法律建议。