仅凭单位法人用其父亲微信号管理员工并发工资这一行为，并不能直接确认劳动者与单位之间存在劳动关系，但该行为可以作为证明劳动关系存在的一个辅助证据。以下从多个角度进行分析：
劳动关系确认的核心要素
根据《关于确立劳动关系有关事项的通知》等相关规定，劳动关系的确认通常需要综合考虑多个因素，包括但不限于：
- 用人单位和劳动者符合法律、法规规定的主体资格：即用人单位需具备合法的用工主体资格，劳动者需达到法定劳动年龄且具备劳动能力。
- 用人单位依法制定的各项劳动规章制度适用于劳动者，劳动者受用人单位的劳动管理，从事用人单位安排的有报酬的劳动：这通常表现为劳动者需遵守用人单位的规章制度，接受用人单位的管理和指挥，并按照用人单位的安排完成工作任务，同时获得相应的劳动报酬。
- 劳动者提供的劳动是用人单位业务的组成部分：即劳动者所从事的工作需是用人单位业务范围内的一部分。
微信号管理并发工资行为的法律意义
- 辅助证据作用：单位法人用其父亲微信号管理员工并发工资，这一行为本身并不直接证明劳动关系的存在。然而，如果该微信号被用于发布工作任务、安排工作时间、进行工作考核或支付工资等与劳动关系密切相关的活动，那么该微信号中的聊天记录、转账记录等可以作为证明劳动关系存在的辅助证据。
- 需结合其他证据：要确认劳动关系，通常还需要结合其他证据，如劳动合同、工作证、考勤记录、工资条、社保缴纳记录等。这些证据能够更直接地证明劳动者与用人单位之间存在劳动关系。
可能的法律后果与建议
- 法律后果：如果劳动者无法提供足够的证据证明与用人单位之间存在劳动关系，可能会面临维权困难的情况。例如，在申请工伤认定、要求用人单位支付工资或经济补偿等情况下，如果无法证明劳动关系，相关请求可能会被驳回。
- 建议：
- 保留证据：劳动者应尽可能保留与用人单位之间存在劳动关系的证据，如劳动合同、工作证、考勤记录、工资条、微信聊天记录等。
- 及时维权：如果劳动者认为自己的权益受到侵害，应及时向劳动监察部门投诉或向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，以维护自己的合法权益。
- 咨询专业律师：在处理劳动争议过程中，劳动者可以咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和指导。
总结来说，单位法人用其父亲微信号管理员工并发工资并不能直接确认劳动关系，但可以作为辅助证据。要确认劳动关系，通常需要结合其他证据进行综合判断。劳动者应保留好相关证据，并在必要时及时维权或咨询专业律师。