探亲假期间扣绩效工资是否合理，需根据具体情况来判断，一般情况下不应随意扣减，但具体是否扣除需依据用人单位的规章制度、劳动合同约定以及绩效工资的核算方式来确定。以下是从不同角度进行的分析：
一、法律规定与基本工资保障
根据《国务院关于职工探亲待遇的规定》，职工在规定的探亲假期和路程假期内，应按照本人的标准工资发给工资。这里的“标准工资”通常指的是职工的基本工资等相对固定的工资组成部分。因此，无论单位如何规定，探亲假期间员工的基本工资都应得到保障，这是法律明确规定的。
二、绩效工资的核算与发放原则
绩效工资作为员工收入的一部分，其核算和发放往往与员工的工作成果、工作量、业绩指标完成情况等因素紧密相关。如果绩效工资严格根据员工的实际工作成果来核算（如销售人员的销售业绩），由于探亲假期间员工未实际参与工作，无法产生相应的工作成果，那么单位不发放这部分绩效工资在理论上是有一定合理性的。但这种合理性必须建立在合法合规的制度规定之上，且不能违反法律法规的强制性要求。
三、用人单位规章制度的重要性
用人单位的规章制度对于探亲假期间绩效工资的发放具有决定性作用。如果规章制度中有明确且合法的规定，且该规定不违反法律法规的强制性要求，同时已经过民主程序制定并向劳动者公示，那么就应按照规章制度执行。因此，劳动者在入职时应仔细了解并阅读公司的规章制度，特别是关于薪资福利的部分，以确保自己的权益得到充分保障。
四、实际操作建议与权益保护
查阅劳动合同和公司规章制度：在休探亲假前，劳动者应仔细查阅劳动合同和公司规章制度，了解公司对探亲假期间工资及绩效奖金的具体规定。
与公司沟通：如有疑问或争议，可与公司的人力资源部门或相关负责人进行沟通，明确探亲假期间绩效奖金的发放政策。
依法维权：如果公司无故扣减探亲假期间的绩效奖金，劳动者有权向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。在维权过程中，劳动者应保留好相关证据，如劳动合同、公司规章制度、工资条等，以便在需要时提供证明。
五、特殊情况的处理
在某些特殊情况下，如公司的绩效考核周期与探亲假时间重叠，且绩效奖金的发放与考核周期内的工作表现直接相关，公司可能会根据具体情况对绩效奖金进行调整。但这种调整必须合理合法，不能随意扣减，且应事先与劳动者进行充分沟通并达成一致。
总结来说，探亲假期间扣绩效工资是否合理，需根据用人单位的规章制度、劳动合同约定以及绩效工资的核算方式来确定。劳动者应充分了解自己的权益和义务，并在遇到争议时及时寻求法律帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。