核心结论：若工伤停工留薪期满后，因脑外伤后遗症导致新骨折，单位不承认新的停工留薪期，可通过以下途径解决：

1. 申请劳动能力鉴定委员会确认停工留薪期
   根据《工伤保险条例》第三十三条，停工留薪期一般不超过12个月，伤情严重或情况特殊可适当延长，但需经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认。

   • 操作步骤：向当地劳动能力鉴定委员会提交书面申请，附上病历、诊断证明、影像资料等证据，证明新骨折与工伤（脑外伤）的因果关系及治疗必要性。
     
   • 法律依据：若鉴定委员会确认新骨折属于工伤复发或后遗症导致，可重新核定停工留薪期，单位需按原待遇支付工资。

2. 通过劳动仲裁主张权益
   若单位拒绝承认鉴定结论或拒付待遇，可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁：

   • 仲裁请求：要求单位支付停工留薪期工资、医疗费等，并确认新骨折属于工伤范畴。
     
   • 证据准备：除医疗证据外，需提供工伤认定书、原停工留薪期文件、与单位沟通记录（如邮件、录音）等，证明单位存在过错。
     
   • 法律依据：根据《劳动争议调解仲裁法》第二条，因工伤医疗费等发生的争议属于仲裁范围。

3. 诉讼途径（仲裁后）
   若对仲裁结果不服，可在收到裁决书15日内向法院起诉：

   • 诉讼重点：围绕新骨折与工伤的因果关系、单位是否履行法定义务（如申请延长停工留薪期）展开举证。
     
   • 风险提示：诉讼周期较长，需充分准备证据，建议委托律师协助。

关键点提示：

• 脑外伤后遗症导致的新骨折，需通过医学鉴定明确与工伤的关联性，否则可能被认定为非工伤疾病。
  
• 单位若未在停工留薪期满前主动申请延长，劳动者可自行申请，单位不得单方面否定。
  
• 保留所有医疗记录、沟通记录，作为后续维权的核心证据。
  

如有进一步细节（如单位具体拒绝理由、新骨折诊断时间等），可提供后继续分析。