当调查取证被拒绝时，你可以根据不同情况采取以下措施来应对：
一、针对法院拒绝调查取证的情况
了解拒绝理由：
- 法院拒绝调查取证通常会在裁定书中说明理由。常见的拒绝理由可能包括申请事项与案件无关、证据不属于法院依职权或依申请调取的范围、申请不符合法定程序等。
- 你应仔细阅读裁定书，了解法院拒绝的具体理由，以便有针对性地采取后续措施。
申请复议：
- 根据《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》第十九条，如果你对人民法院不予准许调查收集证据的申请有异议的，可以在收到通知书的次日起三日内向受理申请的人民法院书面申请复议一次。
- 复议申请应针对法院拒绝的理由进行有针对性的反驳，并提供相关法律依据和事实支持。例如，如果法院以“不属于法定调取范围”为由拒绝，你可以结合《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》第十七条，说明证据属于国家有关部门保存并须法院依职权调取的档案材料，或涉及国家秘密、商业秘密、个人隐私，或其他因客观原因无法自行收集的情形。
向上级法院申诉或申请监督：
- 如果复议被驳回，你还可以考虑向上级法院申诉，请求上级法院对下级法院的决定进行监督。但这一步骤通常较为困难，需要你提供充分的证据证明下级法院的决定存在错误。
- 另外，你也可以向检察机关申请法律监督，请求检察机关对法院的拒绝行为进行审查。
二、针对第三方机构拒绝配合调查取证的情况
法院依法采取强制措施：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》第一百一十七条，如果有关单位拒绝或者妨碍人民法院调查取证的，人民法院除责令其履行协助义务外，并可以予以罚款。对个人可以处以10万元以下的罚款，对单位可以处以5万元以上100万元以下的罚款。
- 对主要负责人或直接责任人员还可以处以拘留（15日以下），构成犯罪的依法追究刑事责任。
- 你可以向法院申请对拒绝配合的第三方机构采取强制措施，以获取所需证据。
申请法院责令提交：
- 如果证据由对方当事人持有且无正当理由拒不提供，你可以根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第一百一十二条，申请法院责令对方当事人提交。
- 若对方当事人无正当理由拒不提交，法院可以认定你所主张的书证内容为真实。
三、其他应对措施
自行收集或委托律师收集证据：
- 如果法院或第三方机构拒绝调查取证，你可以尝试通过其他合法途径自行收集证据。例如，向相关单位或个人发出调查函、询问笔录等。
- 你也可以委托专业律师协助收集证据，律师可以利用其专业知识和经验，采用合适的调查方法和程序来获取证据，如申请开具律师调查令。
在后续庭审中充分说明情况：
- 即便调查取证申请被拒，你在庭审过程中仍有机会详细阐述该证据的重要性以及申请过程和被拒情况，让法官全面了解案件证据的全貌和争议焦点。
评估证据缺失对案件的影响并制定替代方案：
- 你需要评估证据缺失对案件的影响程度，如果影响较大，应提前制定替代方案，如寻找其他证据来支持你的主张或调整诉讼策略。
在处理调查取证被拒绝的情况时，务必保持冷静和理性，依法维护自己的合法权益。如果你在此过程中遇到任何困难或疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议和帮助。