若诉讼时效已经届满且案件已错误立案，在实体审判阶段法院通常会驳回原告的诉讼请求，但存在特殊情形时法院可能不会主动适用诉讼时效规定或支持原告请求。具体分析如下：

1. 法院主动审查与驳回请求
   根据《民法典》及相关司法解释，诉讼时效届满后，权利人丧失的是胜诉权而非起诉权。若案件已立案进入实体审判阶段，法院会主动审查诉讼时效问题。若确认时效届满且无中断、中止等法定事由，法院将直接驳回原告的诉讼请求，即使被告未提出时效抗辩（部分地区法院可能要求被告明确抗辩后才审查，但主流实践仍以主动审查为原则）。

2. 被告未提出时效抗辩的例外
   若被告在庭审中未以诉讼时效届满为由进行抗辩，法院通常不会主动依职权驳回原告请求。此时，案件可能进入实体审理，原告仍有机会通过证据证明其权利合法性。但需注意，若被告在二审中首次提出时效抗辩，法院可能不予支持（除非一审未涉及时效问题且二审发现明显违反法律强制性规定）。

3. 特殊情形下的时效不适用

   • 履行义务认可：若被告在诉讼时效届满后，通过书面文件、还款计划等形式明确表示愿意履行义务，或实际履行了部分义务，法院可能认定被告放弃时效利益，从而支持原告请求。
     
   • 特殊权利保护：对支付存款本金及利息请求权、兑付国债、金融债券等特殊权利，法律明确规定不适用诉讼时效，即使超过一般时效期间，法院仍会支持原告主张。
     
   • 未成年人遭受性侵害的损害赔偿请求权：自受害人年满十八周岁之日起计算诉讼时效，且存在最长保护期限限制，此类案件不受普通时效限制。

实务建议：

• 原告应在诉讼时效届满前及时主张权利，避免因时效问题丧失胜诉权；
  
• 若时效已届满，可尝试通过与被告协商达成还款协议、要求被告出具还款承诺等方式“重启”时效；
  
• 被告若欲以时效抗辩，应在答辩期内明确提出，并附相关证据证明时效届满事实。
  

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