结论：合同盖公章后的扫描件在大多数情况下是有效的，但其法律效力需结合具体情况、双方共识以及法律规定进行综合判断。
一、扫描件有效性的法律基础
根据《中华人民共和国民法典》第四百六十九条的规定，书面形式包括合同书、信件等可以有形地表现所载内容的形式，同时将以电子数据交换、电子邮件等方式能够有形地表现所载内容，并可以随时调取查用的数据电文视为书面形式。因此，扫描合同作为电子数据形式的一种，若满足上述条件，则具备成为有效合同的形式基础。
二、影响扫描件有效性的关键因素
双方真实意思表示：
- 关键在于双方在签订合同过程中是否均基于真实意愿表达，不存在欺诈、胁迫、重大误解等情形。若双方经过平等协商，均认可合同条款，并通过扫描方式完成盖章和回传，则合同通常有效。
合同内容合法合规：
- 合同内容必须不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。例如，租赁合同中的租赁标的、租金、租赁期限等条款均需符合法律规定。
其他证据佐证：
- 除扫描合同本身外，若存在如聊天记录、交易凭证、发货单、收货单等其他证据，形成完整的证据链，可进一步证明合同的有效性。例如，双方通过邮件确认了合同条款，并按照约定进行了交易，这些邮件和交易记录可以作为佐证扫描合同有效性的证据。
合同约定与双方共识：
- 如果合同本身明确规定了可以以电子形式签署和存储，或双方当事人均认可这种签署方式，并且在实际履行中没有异议，则扫描合同同样有效。例如，双方在合同中约定“本合同以电子形式签署，扫描件与原件具有同等法律效力”，且在实际履行中均按照此约定执行。
三、可能无效的情形
无法证明真实性：
- 若一方对扫描合同的真实性提出质疑，且另一方无法提供充分证据证明盖章的真实性或双方的真实合意，则合同效力可能不被认可。例如，一方声称扫描合同上的公章是伪造的，但无法提供其他证据证明合同的真实性，此时扫描合同的效力可能受到质疑。
违反法律强制性规定：
- 合同内容若违反法律、行政法规的强制性规定，即使以扫描形式签订，也会被认定为无效。例如，合同中约定了非法交易的内容，无论以何种形式签订，均无法获得法律保护。
恶意串通损害他人利益：
- 双方若恶意串通，通过扫描合同损害国家、集体或第三人利益，该合同同样无效。例如，双方为了逃避税收而签订虚假的租赁合同，这种合同是无效的。
特定业务要求原件：
- 对于某些需要原件才能办理的业务，如产权过户等，扫描件可能无法满足法律要求，此时需使用原件。例如，在办理房产过户手续时，通常需要提供房产证的原件，扫描件可能无法被接受。
四、建议与实践指导
- 使用可靠电子签名：为降低法律风险，建议使用可靠的电子签名方式进行合同签订。电子签名具有更高的安全性和可信度，能够更好地证明合同的真实性和双方的真实合意。
- 妥善保存证据：无论采用何种形式的合同，双方都应妥善保存与合同签订和履行相关的所有证据，以便在必要时进行举证。例如，保存好合同原件、扫描件、聊天记录、交易凭证等。
- 明确合同条款：在签订合同时，应明确约定合同的形式、签署方式、效力等条款，以避免后续产生争议。例如，可以在合同中约定“本合同以电子形式签署，扫描件与原件具有同等法律效力”。
综上所述，合同盖公章后的扫描件在符合相关法律规定和双方共识的前提下，通常具有法律效力。然而，在具体应用中仍需注意合同的特定要求、双方的实际履行情况以及法律规定的变化。如有任何疑问或需要进一步的法律指导，请直接向我咨询。