关于高校研发项目自筹资金离职后能否退还的问题，结论需分情况讨论，具体如下：

1. 若自筹资金属于个人投入且未约定归属
   根据《民法典》合同编及《劳动法》相关规定，若自筹资金系您个人财产（如工资、储蓄等）投入项目，且未与高校或项目方签订书面协议明确资金归属、使用规则或离职处理方式，则资金原则上仍归您个人所有。离职时，您有权要求返还剩余资金，但需提供资金来源证明（如转账记录、工资单等）。
   例外情形：若资金已用于购买项目专用设备、材料等固定资产，且高校主张所有权，可能需通过协商或诉讼解决归属争议。

2. 若自筹资金属于项目专项经费或高校配套资金
   若资金来源于高校科研经费、政府专项拨款或企业合作资金（即使以“自筹”名义），且项目协议中明确约定“资金需专款专用”“离职时需退还剩余部分”或“资金所有权归高校”，则离职时您需按协议退还资金。
   法律依据：根据《劳动合同法》第22-25条，若高校在劳动合同或项目协议中合法约定了服务期、竞业限制或资金返还条款，您需遵守约定，否则可能承担违约责任。

3. 若资金性质模糊且无书面协议
   实践中，高校研发项目资金常涉及多方投入，若资金性质（如是否为借款、投资或赠与）无明确约定，可能引发争议。此时需结合以下因素综合判断：

   • 资金用途：是否用于项目研发必需支出（如设备、试剂、差旅费）；
     
   • 高校管理规则：是否通过校内财务制度、科研管理办法等文件对资金使用作出规定；
     
   • 实际控制权：资金是否由您个人支配，或需经高校审批后使用。
     建议：若争议无法协商解决，可申请劳动仲裁或提起民事诉讼，由法院或仲裁机构根据证据认定资金归属。

法律建议：

1. 核查协议文件：优先检查劳动合同、项目合作协议、科研经费管理办法等文件，明确资金性质及离职处理条款；
   
2. 保留证据：保存资金投入凭证（如转账记录、发票）、项目支出明细、高校审批记录等，以证明资金来源及使用情况；
   
3. 协商解决：若高校主张退还，可尝试协商分期退还或以项目成果折抵部分资金；
   
4. 法律途径：若协商无果，可向当地劳动仲裁委员会申请仲裁，或向法院提起诉讼，主张资金所有权或抗辩退还义务。

风险提示：

• 若高校已将资金列入科研经费审计范围，擅自挪用或拒绝退还可能涉及职务侵占或违约责任；
  
• 若项目涉及国家秘密或商业秘密，离职时可能需遵守保密义务，但保密义务与资金退还无直接关联。

如有进一步疑问或需具体分析协议条款，可直接向我咨询，我会结合您的实际情况提供更详细的法律意见。