合作社以农机入股的行为，在符合法定条件和程序的情况下是合法的。以下从不同角度为你详细分析：

1. 法律依据角度
   根据《中华人民共和国农民专业合作社法》第十四条，设立农民专业合作社需满足五项条件，其中第五项明确规定“有符合章程规定的成员出资”。农机作为生产资料属于合法出资形式，只要农机产权清晰（如无抵押、查封等权利限制），且经全体成员评估作价（可协商或委托专业机构评估），即可作为出资入股。例如，某农机合作社章程约定“大型收割机按购置价80%折算股金”，符合法定程序即合法。

2. 操作程序角度
   合法性需满足三个关键程序：

   • 产权确认：入股农机需完成权属登记（如农机牌照、购置发票等），避免权属纠纷；
     
   • 价值评估：建议通过合作社成员大会协商确定价值，或委托第三方评估机构出具报告；
     
   • 章程记载：需在合作社章程中明确农机型号、数量、作价金额及权益分配方式（如分红比例、折旧处理等）。
     若未履行上述程序，可能因“出资不实”引发法律风险。

3. 风险防范角度
   需注意两类特殊情形：

   • 农机抵押问题：若入股农机已设定抵押，需取得抵押权人书面同意，否则可能因《民法典》第三百九十九条被认定无效；
     
   • 农机报废风险：建议在章程中约定“农机自然损耗或技术淘汰时的处理方式”（如按残值折股或强制退股），避免纠纷。
     例如，某合作社因未约定农机报废条款，导致成员对一台报废拖拉机的股金处理产生争议，最终通过诉讼解决。

建议行动：若你正在操作农机入股，可按以下步骤操作：

1. 核查农机产权证明（如购置发票、行驶证）；
   
2. 召开成员大会协商作价方案；
   
3. 委托评估机构出具报告（可选）；
   
4. 修改合作社章程并办理工商备案。
   如有具体操作疑问，可进一步向我咨询细节。