结论：在知识产权被刑事立案的情况下，部分受害人没有报案且私下和解的金额，一般不能简单地从犯罪金额中扣除，但具体是否计入犯罪金额需结合案件具体情况和法律规定进行综合判断。

分析说明：

1. 犯罪金额的认定原则：

   • 在知识产权刑事案件中，犯罪金额的认定通常遵循“实际损失原则”或“违法所得原则”。即，犯罪金额一般是指犯罪行为给权利人造成的实际损失，或者犯罪嫌疑人通过犯罪行为所获得的违法所得。
   • 私下和解的金额，虽然可能反映了部分受害人与犯罪嫌疑人之间的协商结果，但并不直接等同于犯罪行为给所有权利人造成的实际损失或犯罪嫌疑人的违法所得。

2. 私下和解金额与犯罪金额的关系：

   • 如果私下和解的金额是受害人与犯罪嫌疑人之间就特定侵权行为所造成的损失达成的赔偿协议，且该协议金额合理反映了实际损失，那么这部分金额在理论上可能被视为对实际损失的一种补偿。然而，在刑事立案后，犯罪金额的认定通常由司法机关根据证据和法律规定进行，不会直接因私下和解而改变。
   • 私下和解并不改变犯罪行为的性质和犯罪金额的认定。即使部分受害人选择了私下和解，司法机关仍会根据其他受害人的报案、证据收集情况以及法律规定，对犯罪嫌疑人的犯罪金额进行综合认定。

3. 可能影响犯罪金额认定的因素：

   • 证据的充分性：司法机关在认定犯罪金额时，会依据充分的证据。如果私下和解的金额有充分的证据支持，且该证据与犯罪行为的实际损失或违法所得相关联，那么这部分金额可能在认定犯罪金额时被考虑。
   • 受害人的报案情况：虽然部分受害人没有报案，但如果其他受害人的报案和证据足以证明犯罪嫌疑人的犯罪行为和犯罪金额，那么私下和解的金额可能不会对整体犯罪金额的认定产生决定性影响。
   • 法律规定的适用：不同类型的知识产权刑事案件（如假冒注册商标罪、侵犯著作权罪等）可能有不同的犯罪金额认定标准和法律规定。司法机关在认定犯罪金额时，会严格依照相关法律规定进行。

法律建议：

• 对于犯罪嫌疑人而言，如果希望私下和解的金额能够被司法机关在认定犯罪金额时考虑，应积极配合司法机关的调查工作，提供充分的证据证明私下和解的金额与犯罪行为的实际损失或违法所得相关联。
• 对于受害人而言，如果选择了私下和解，但仍希望追究犯罪嫌疑人的刑事责任，应及时向司法机关报案并提供相关证据。同时，也可以考虑在私下和解协议中约定保留追究刑事责任的权利。
• 在任何情况下，都建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。律师可以根据案件的具体情况和法律规定，为当事人提供针对性的法律策略和辩护方案。

后续行动建议：

• 如果您是犯罪嫌疑人或受害人，且涉及知识产权刑事案件，建议尽快咨询专业律师以了解您的权利和义务。
• 律师将协助您收集证据、准备法律文件，并在司法程序中代表您进行辩护或主张权利。
• 请保持与司法机关的沟通联系，及时了解案件进展和司法机关的要求。