结论：农民工体检不合格时，体检费用及车费的承担问题需根据具体情况判断，一般而言，若体检为施工单位要求且与工作相关，施工单位应承担费用；若体检为农民工自行要求或与工作无关，则费用可能由农民工自行承担。以下为详细分析：

一、体检费用承担

1. 施工单位要求的体检：

   • 若体检是施工单位为了保障工作安全、符合行业规定或法律法规要求而组织的，且体检项目与农民工所从事的工作直接相关，那么即使体检结果不合格，体检费用也应由施工单位承担。这是因为施工单位有义务确保工作环境的健康与安全，并承担因工作需要而产生的相关费用。

2. 农民工自行要求的体检：

   • 若体检是农民工自行要求进行的，且与工作无直接关联，或者体检项目超出了施工单位要求的范围，那么体检费用通常应由农民工自行承担。在这种情况下，体检被视为农民工的个人行为，与施工单位无直接责任关系。

二、车费承担

1. 与体检相关的车费：

   • 若车费是因参加施工单位组织的体检而产生的，且该体检是施工单位要求的必要程序，那么车费也应由施工单位承担。这同样基于施工单位有义务为农民工提供必要的工作条件和保障。

2. 非体检相关的车费：

   • 若车费与体检无直接关联，如农民工因个人原因前往体检地点或返回住处的车费，则这些费用应由农民工自行承担。

三、特殊情况考虑

• 合同约定：如果农民工与施工单位之间签订了劳动合同或相关协议，且协议中明确规定了体检费用及车费的承担方式，那么应按照合同约定执行。
• 法律法规：根据相关法律法规，如《劳动法》、《劳动合同法》等，施工单位有义务为农民工提供必要的工作条件和劳动保护，包括可能的体检费用。但具体规定可能因地区和行业而异，需结合当地法律法规进行判断。

四、建议与行动

• 协商解决：在发生争议时，农民工应首先与施工单位进行协商，尝试达成一致意见。
• 寻求法律援助：若协商无果，农民工可以向当地劳动监察部门投诉或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。
• 保留证据：农民工应保留好体检报告、车费票据等相关证据，以便在需要时提供证明。

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