针对“三人支部委员中两人辞职”这一情况，核心处理方式需依据党内相关规定及组织程序进行，具体分为以下两种情况处理：

1. 若辞职申请尚未生效或组织未批准

• 程序要求：根据《中国共产党基层组织选举工作条例》及党内职务任免相关规定，支部委员的辞职需经支部党员大会讨论决定，并报上级党组织批准。若两人仅提交辞职申请但未完成上述程序，原支部委员会仍应继续履职，确保组织工作正常运转。
• 建议行动：
  • 立即召开支部委员会会议，讨论辞职申请的初步意见；
  • 将辞职申请及支部委员会意见提交支部党员大会审议；
  • 报上级党组织备案或审批，待批准后生效。

2. 若辞职申请已生效（组织批准或默认批准）

• 组织架构影响：三人支部委员会中两人辞职后，支部委员会将无法形成有效决议（需半数以上委员出席），此时需启动补选或调整程序。
• 处理方式：
  • 补选委员：若支部党员人数仍符合设立委员会条件（通常需7名以上党员），应在上级党组织指导下，尽快召开支部党员大会补选委员，恢复委员会正常运作。
  • 改选支部班子：若党员人数不足设立委员会条件，可报上级党组织批准，撤销支部委员会，改设支部书记1名，由支部党员大会选举产生。
  • 临时过渡措施：在补选或改选完成前，可由上级党组织指定1名现任委员或党员负责人主持工作，确保组织生活不中断。

关键注意事项

• 时效性：辞职生效后应尽快启动后续程序，避免组织瘫痪；
• 合规性：所有操作需严格遵循党章及党内法规，不得擅自简化程序；
• 沟通协调：及时向上级党组织汇报情况，争取指导与支持。

总结：三人支部委员两人辞职后，需根据辞职是否生效分情况处理，核心是确保组织程序合规、工作连续，避免出现管理真空。如有具体操作疑问，可进一步向我咨询细节。