核心结论：运营公司司机车辆被撞导致停运，赔偿问题需根据事故责任划分、停运损失的证明及保险情况综合确定，具体如下：

1. 责任划分是赔偿前提
   根据《道路交通安全法》第76条，事故责任由交警部门出具的《交通事故责任认定书》确定。若对方全责，其需承担全部停运损失；若双方均有责任，则按责任比例分担。例如，对方负70%责任，则需赔偿停运损失的70%。

2. 停运损失的赔偿范围
   停运损失指车辆因事故无法正常运营导致的合理收入减少，包括：

   • 固定成本：如司机工资、车辆折旧、保险费用等（需按停运时间分摊计算）；
     
   • 预期收益：如日常运营收入（需提供近3-6个月的运营流水、合同等证明实际收入水平）。
     注意：若车辆为非营运车辆（如私家车），即使用于运营，停运损失可能因“非法营运”不被支持，需以车辆性质为准。

3. 保险理赔的优先级

   • 交强险：优先赔偿，但财产损失限额仅2000元，通常不足以覆盖停运损失；
     
   • 商业三者险：需查看保险合同条款。若条款明确排除“停运损失”，则需对方个人承担；若未排除，保险公司可能赔偿（但实践中常以“间接损失”为由拒赔，需通过诉讼主张）。
     建议：立即联系对方保险公司，要求出具《拒赔通知书》以便后续维权。

4. 维权路径与证据收集

   • 协商：与对方或保险公司直接沟通，出示运营合同、收入证明、维修记录等证据；
     
   • 诉讼：若协商无果，可向法院起诉，需准备：
     
     • 事故责任认定书；
       
     • 车辆维修证明及停运时间（如维修厂出具的进出场记录）；
       
     • 收入损失证明（如银行流水、纳税记录、客户订单等）。
       提示：诉讼时效为3年，自知道权益受损之日起计算。

5. 特殊情形处理

   • 挂靠车辆：若车辆挂靠在运营公司，司机需与挂靠公司协商赔偿主体（通常以实际运营方为准）；
     
   • 无证驾驶/酒驾：若对方存在重大过错，保险公司可能拒赔，需直接向对方追偿。

行动建议：立即固定证据（如拍照、录像、保存维修单据），联系对方及保险公司协商，若7日内未达成一致，建议委托律师介入调查取证，通过法律途径主张权益。如有进一步细节（如车辆性质、保险情况等），可随时补充说明，我会为您细化分析。