年休假赔偿是按照应得工资来计算的，而非实得工资。以下是对这一问题的详细解释：
一、法律依据与解释
根据《企业职工带薪年休假实施办法》第十一条的规定，计算未休年休假工资报酬的日工资收入按照职工本人的月工资除以月计薪天数（21.75天）进行折算。这里的月工资是指职工在用人单位支付其未休年休假工资报酬前12个月剔除加班工资后的月平均工资。重要的是，这个计算基数是应得工资，即包含了职工应缴纳的社会保险、住房公积金等费用在内的工资总额，而非扣除这些费用后的实得工资。
二、具体计算方式
确定月平均工资：首先，需要计算职工在用人单位支付其未休年休假工资报酬前12个月的月平均工资。这个平均工资是剔除了加班工资后的，以更准确地反映职工的正常工资水平。
计算日工资：然后，将月平均工资除以月计薪天数（21.75天），得到职工的日工资。
计算赔偿金额：最后，根据职工未休年休假的天数，乘以日工资的三倍（因为按照规定，用人单位未安排职工休年休假，应当按照该职工日工资收入的300%支付年休假工资报酬，其中包含用人单位支付职工正常工作期间的工资收入，因此实际赔偿为日工资的两倍加上正常工资，但通常表述为三倍日工资，理解上需注意正常工资已包含在内，赔偿部分为两倍日工资，但计算基数仍按三倍日工资的标准来确定赔偿的“应得”部分），来确定应支付的年休假赔偿金额。不过，在实际操作中，由于正常工资已经支付，所以用人单位通常只需额外支付两倍的日工资作为赔偿。但计算基数（即用于确定赔偿金额的日工资）是按照应得工资来计算的。
示例计算： 假设职工的月平均工资为5000元（已剔除加班工资），那么其日工资为5000元 ÷ 21.75天 ≈ 229.89元。如果职工未休年休假5天，那么用人单位应支付的年休假赔偿金额（额外支付部分）为229.89元 × 2天 × 5天 = 2298.9元（这里乘以2天是因为正常工资已支付，只需额外支付两倍日工资）。但理解上，我们是基于三倍日工资的标准来确定赔偿的“应得”总额（即如果包括正常工资在内应为229.89元 × 3天 × 5天 = 3448.35元，其中1149.45元为正常工资部分，已支付，所以额外支付2298.9元）。
三、注意事项
加班工资剔除：在计算月平均工资时，需要剔除加班工资，以更准确地反映职工的正常工资水平。
社会保险与住房公积金：应得工资包含了职工应缴纳的社会保险、住房公积金等费用，这些费用在计算赔偿金额时不需要扣除。
及时主张权利：如果职工认为用人单位未依法安排年休假或未支付年休假工资报酬，应及时向用人单位主张权利，或者向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁等。
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